goby

goby 2.0

در گاوماهیان است یک API پایتون برای خواندن فایل های داده های باینری ایجاد شده با استفاده گاوماهیان نسل بعدی چارچوب مدیریت داده ها.به طور معمول، این شاخه می آید به عنوان بخشی از بسته گاوماهیان کامل، در دسترس از:& nbsp؛ از HTTP: //goby.campagnelab.org/بسته کامل شامل کد منبع جاوا. اگر شما از PyPI و یا برخی از منبع پایتون...

Jmol

Jmol 14.29.14 به روز شده

Jmol یک منبع باز، نرم افزار متقابل پلت فرم و گرافیکی رایگان است که در ابتدا طراحی شده است تا به عنوان بیننده مولکولی برای ساختارهای شیمیایی 3D عمل کند. این برنامه در چهار حالت مستقل اجرا می شود، به عنوان یک برنامه وب HTML5، یک برنامه جاوا، یک برنامه جاوا و یک جزء جانبی بدون سرور است. Feaurs در یک نگاه ویژگی های کلیدی...

LSim

LSim 1.0.0

در LSim superposes تراکم الکترون ماکرومولکولی و محاسبه نمره شباهت ساختاری. محاسبات آن در مقیاس خطی با اندازه مولکول که در مقایسه با.صف LSim می مفهومی به عناصر ساختاری بیوشیمیایی نامربوط و در نتیجه، بی طرفانه و برای مطالعات شباهت پروتئین تنها ساختار مناسب هستند.نصب و راه اندازی:باز کردن فایل های توزیع:تار -xzvf...

MACS2

MACS2 2.0.10.20130731

در MACS2 یک مدل مبتنی بر ابزار تجزیه و تحلیل برای داده های تراشه-SEQ است.با بهبود تکنیک تعیین توالی، immunoprecipitation کروماتین و پس از تعیین توالی عملیاتی بالا (تراشه SEQ) محبوب شدن است به مطالعه تعاملات پروتئین DNA ژنوم گسترده. برای پرداختن به عدم استفاده از روش تجزیه و تحلیل تراشه SEQ قدرتمند، ما یک الگوریتم...

در massXpert جرم بسته طیف سنجی یک محیط طیف سنجی جرمی برای خطی (زیستی) پلیمرهای است. آن را به ارث تمام نوآوری های polyxmass GNU، آن را به عنوان یک پورت آن پروژه را به یک محیط توسعه کراس پلت فرم است در چه در این نسخه جدید است. در ارتقاء در XpertMiner ماژول که کار با لیست ها آسان تر کند؛اشکال محاسبه ثابت است که به...

MetagenomeDB

MetagenomeDB 0.2.2

. MetagenomeDB عمل به عنوان لایه انتزاعی در بالای یک پایگاه داده MongoDB؛ MetagenomeDB یک کتابخانه پایتون طراحی به راحتی ذخیره، بازیابی و حاشیه نویسی توالی metagenomic و nbsp است. آن را فراهم می API برای ایجاد و اصلاح و اتصال دو نوع از اشیاء، یعنی توالی و مجموعه:از & nbsp؛ * * * * توالی (کلاس دنباله) می تواند بار...

misopy

misopy 0.4.9

در MISO (مخلوط ایزوفرم) یک چارچوب احتمالاتی نوشته شده در پایتون که quantitates سطح بیان و nbsp است. ژن معادل متصل از داده های RNA-SEQ، و شناسایی ایزوفرم متفاوت تنظیم و یا اگزون در سراسر نمونه.با مدل سازی فرایند مولد است که توسط آن می خواند از ایزوفرم در RNA-SEQ تولید، مدل MISO استفاده از استنتاج بیزی برای محاسبه...

mpiBLAST

mpiBLAST 1.4.0-pio / 1.5.0 Beta 1

در mpiBLAST اجرای موازی MPI مبتنی بر BLAST NCBI است. این پروژه شامل یک جفت از برنامه هایی که جایگزین formatdb و blastall با نسخه های که اجرا مشاغل BLAST به صورت موازی در یک خوشه از کامپیوترهای با MPI نصب شده است. دو مزیت اصلی برای استفاده از mpiBLAST مقابل BLAST سنتی وجود دارد.اول، mpiBLAST تجزیه پایگاه داده در سراسر...