در ProteinShop یک ابزار تعاملی برای دستکاری ساختارهای پروتئینی است. آن را به سرعت ایجاد مجموعه ای از تنظیمات پروتئین با استفاده از دانش بشری و شهود طراحی شده است. این تنظیمات را می توان به بهینه سازی محلی و یا جهانی قرار داشته است. اگر چه ProteinShopمی کند فرآیند بهینه سازی جهانی به خودی خود انجام نشده است، آن را...
در pyNetConv یک کتابخانه پایتون ایجاد برای کمک به تبدیل برخی از فرمت های فایل های شبکه است.از آنجایی که نسخه 0.6، pyNetConv است که قادر به خواندن / نوشتن (و تبدیل از / به) از فرمت های فایل های زیر...
. Pysam یک ماژول پایتون برای خواندن و دستکاری Samfiles و nbsp است. این یک لفاف بسته بندی سبک وزن از samtools C-API است.راهنمای سریع است که در اینجا. مستندات دقیق بیشتر اینجا موجود است.پرسش ها و نظرات بسیار خوش آمدید و باید به گروه کاربر pysam در http://groups.google.com/group/pysam-user-groupWhat ارسال جدید در این...
در PySCeS یک پروژه توسط سه گانه-J گروه برای سلول مولکولی فیزیولوژی و nbsp توسعه یافته است؛ به منظور مدل را امتحان کنید و درک فرآیندهای پیچیده و سیستم های که سلول زنده را تشکیل می دهند ویژگی ها:. یک زبان توصیف مدل مبتنی بر متن.ماژول تجزیه و تحلیل ساختاری.انتگرال برای شبیه سازی زمانحل غیر خطی برای تجزیه و تحلیل حالت...
در reciprocal_smallest_distance یک الگوریتم orthology دو به دو که با استفاده از توالی جهانی و حداکثر احتمال فاصله تکاملی بین توالی به دقت تشخیص orthologs بین ژنوم است.نصب از طریق بستهدانلود و untar آخرین نسخه از گیتهاب:سی دی ~-L حلقه...
برنامه ریز RFLP ابزاری است که کمک می کند تا برای برنامه ریزی یک آزمایش RFLP است: می یابد آنزیمهای محدود است که قطع مجموعه ای از توالی های DNA homologue به روش های مختلف و شبیه سازی و در نتیجه تصویر الکتروفورز gel-. این برنامه کمک می کند تا شما برای پیدا کردن آنزیمهای محدود بسیار مهم است که مشخص جمعیت. با شبیه سازی...
مهر ماژول پایتون فراهم می کند که توالی در Hadoop است.مهر و موم از نگاشتکاهش برنامه برای توالی بیولوژیکی است. این در Hadoop (http://hadoop.apache.org) از طریق Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net)، API پایتون نگاشتکاهش و HDFS برای Hadoop اجرا می شود مورد نیاز:. ...
در seriesoftubes خط لوله طولانی برای Solexa داده تراشه SEQ است.مستندات بسته بندی در مورد نیاز:...
سیستم مانند را ساخت اغلب مورد استفاده برای ایجاد گردش کار پیچیده، به عنوان مثال در بیوانفورماتیک و nbsp؛ هدف snakemake برای کاهش پیچیدگی گردش ایجاد شده توسط ارائه یک دامنه به زبان مدرن و تمیز خاص مشخصات (DSL) در سبک پایتون، همراه با یک محیط اعدام سریع و راحت است.نصب- در اوبونتو 12.04، شما می توانید بسته دبیان...
. SSuMMo یک کتابخانه از توابع طراحی اطراف مکررا با استفاده از hmmer به اختصاص توالی به گونه و nbsp است؛ نتایج درختان بسیار مشروح نشان گونه / توزیع جنس در آن جامعه است.برنامه همراه با کد منبع شامل ابزار به: -- ساخت یک پایگاه داده سلسله مراتبی از مدل پنهان مارکوف - dictify.py.- اختصاص توالی به نام طبقه بندی به رسمیت...
