در Staden بسته بندی مجموعه ای کامل توسعه یافته از مونتاژ توالی DNA (Gap4)، ویرایش و ابزار تجزیه و تحلیل (SPIN) برای یونیکس، لینوکس، MacOSX و MS ویندوز است.در جبهه Gap4 چند جزئی پیوستن مرتبط وجود داشته استبهبود در چگونه آن را نمره می پیوندد یافتن پیوندد داخلی وعملکرد دکمه چین در تاریخ ویرایشگر.همچنین در نتیجه به gap4...
در این پروژه STEME زندگی به عنوان یک تقریب به الگوریتم انتظار-Maximisation برای نوع مدل مورد استفاده در یاب موتیف مانند الگوی رفتاری آغاز شده است.STEME برون تقریب EM اجرا می شود منظور از قدر سریع تر از اجرای الگوی رفتاری برای تنظیمات پارامتر معمولی. STEME در حال حاضر به یک یاب موتیف تمام عیار در حق خود توسعه یافته...
مراحل یک بسته برای شبیه سازی تصادفی دقیق سیستم واکنش انتشار در هندسه خودسرانه پیچیده 3D است. الگوریتم شبیه سازی اصلی ما اجرای SSA گیلیسپی است، توسعه یافته به مقابله با انتشار مولکول های بیش از عناصر مش چهار ضلعی 3D.در حالی که به طور عمده برای شبیه سازی مدل دقیق از مسیرهای سیگنالینگ عصبی در دندریت ها و اطراف سیناپس...
در Syntainia یک برنامه ابتکاری برای تجسم از ژنوم چند است لمس و.. ارائه یک رابط کاربری ساده و شهودی برای مشاهده و دستکاری روابط میان گروه های ژن. با تجسم ژن روشن تر، آن را برای محقق به شناسایی حفاظت synteny در میان ژنوم چند آسان تر است. Syntainia یک برنامه کاربردی دسکتاپ است که به نظر می رسد بزرگ و اجرا می کند هموار...
در SyntenyMiner یک برنامه برای نمایش و بازجویی مقایسه میان توالی ژنوم کامل متعدد است. رابط یک دیدگاه کشتیرانی از مسابقات به توالی ژنوم مرجع فراهم می کند. توالی مسابقات بین کروموزوم از ژنوم های مختلف می تواند بیشتر در زمینه یک طرح نقطه مورد بررسی قرار، آشکار rearragements ژنوم هر دو در مقیاس کوچک و بزرگ از جمله وارونه،...
در خوک خرطوم دراز مالایا یک ابزار پایتون که شامل برنامه به منظور برآورد و رسم ارزشمندی را فیلوژنتیک برای مجموعه داده های بزرگ است.با استناد به خوک خرطوم دراز مالایاهنگام استفاده از خوک خرطوم دراز مالایا، لطفا استناد:- Faircloth قبل از میلاد، چانگ J، آلفارو ME: خوک خرطوم دراز مالایا را قادر می سازد تجزیه و تحلیل توان...
در tigreBrowser یک ژن بیان مرورگر مدل برای نتایج از tigre بسته R است (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html).نصب و راه اندازی:tigreBrowser نیاز به پایتون نسخه> = 2.5. tigreBrowser را می توان با دستور زیر نصب:پایتون setup.py نصببرای کسب اطلاعات بیشتر در مورد نصب ماژول های پایتون (به عنوان...
. TRMiner ابزار پایتون است که هدف در موزه داران داده های علمی و nbsp است؛ این اجازه می دهد تا به سرعت در حال هرس مجموعه زیادی از نشریات علمی به احکام مربوط به یک هدف استخراج داده شده است.این است که در دو مرحله به دست آورد. اول، متون را به توالی از نشانه برای کلمات مرتبط tranlated. دوم، الگوهای عبارات منظم در توالی...
پروژه VULCAN تجزیه و تحلیل دینامیک سیالات محاسباتی فراهم می کند.VULCAN (ویسکوز خلاف جهت باد الگوریتم برای تجزیه و تحلیل جریان مجتمع) ارائه می دهد دینامیک سیالات محاسباتی برای سرعت مادون صوت از طریق آشفته مافوق صوت واکنش و غیر واکنش جریان بر روی انواع سیستم عامل های محاسباتی موازی و سریال و.هزینه محاسباتی تجزیه و تحلیل...
