CLC Main Workbench

نرم افزار تصویر:
CLC Main Workbench
جزئیات نرم افزار:
نسخه: 7.7.3 به روز شده
ها تاریخ: 11 Nov 16
توسعه دهنده: CLC bio
پروانه: تجاری
قیمت: 0.00 $
محبوبیت: 342
اندازه: 185186 Kb

Rating: 2.0/5 (Total Votes: 5)

این نسخه ی نمایشی 4 هفته کاملا کاربردی از CLC ترکیبی میز کار کاشت دانه قابل اتصال تمام توالی DNA تجزیه و تحلیل CLC ژن میز کار و توالی پروتئین تجزیه و تحلیل میز کار پروتئین CLC. تجزیه و تحلیل به طور کامل در یک نرم افزار نرم افزار تنها، کاربر پسند، و شهودی یکپارچه

در چه در این نسخه جدید است:

ImprovementsUpdated لیست آنزیم محدود از REBASE & nbsp؛ در اشکال موضوع را با fixesFixed. در حال اجرا بر روی لینک BLAST MacOS در Sierra.Updated PFAM و nbsp؛ گزارش شده توسط Pfam دامنه جستجو tool.Fixed یک موضوع معرفی شده در & nbsp؛ در CLC اصلی میز کار 7.7.2 که در آن آنزیم بر اساس حروف الفبا ذکر شده پس از RdeGBI از دست رفته متیلاسیون informationVarious رفع اشکالات جزئی بودند

. چه جدید در نسخه 7.7.2 است:

در گردش

خروجی گردش کار هم اکنون می توانید پیکربندی شود به طوری که پوشه حاوی خروجی ایجاد می کند.
متغیرهایی جدید در دسترس هستند که تعریف نامهای از خروجی گردش کار: {کاربر}، {میزبان}، و برای عناصر زمان از جسم خروجی، {سال}، {ماه}، {روز}، {ساعت}، {دقیقه} ، {دومین}.
متغیرهایی درون نام خروجی گردش کار است که قبلا فقط به عنوان رقم هم اکنون می توانید با استفاده از نام نوشته شده است مشخص شدند: {NAME} مترادف برای {1} و {} ورودی یک مترادف برای است {2}.

هنگام استفاده از {2} حفره یا سوراخ برای نامگذاری سفارشی در عناصر خروجی گردش کار، تنها ورودی باز خواهد شد به نام تولید گنجانده شده است.




در پی دی اف تولید نشان دادن تمام پارامترهای پیکربندی از یک گردش کار، مطالب برای پارامترهای متصل به یک ابزار و یا یک عنصر ورودی امروزه با نام عناصر تعریف لیست. پیش از این لیست پارامتر برای عناصر خالی شد.




از کجا یک نام ابزار در یک گردش کار تغییر داده شده است، نام اصلی در حال حاضر در کنار نام تغییر شامل زمانی که صادرات پارامترهای کاری می باشد.

در

مشاهده تاریخچه از عناصر داده با استفاده از یک گردش کار در حال حاضر شامل اطلاعات در مورد گردش کار که آنها را ایجاد کرده است.



منظور از ابزار در گردش کار "اضافه کردن عنصر" منو در حال حاضر منظور در منوی میز کار جعبه ابزار منطبق است.
اعتبار سنجی گردش کار بهبود یافته برای کمک به کاربر در شناسایی ورودی خواهد شد که با توجه به پیکربندی عناصر گردش کار کنه.

در و nbsp؛


راه اندازی

در و nbsp؛



ابزار راه اندازی سریع در حال حاضر تحت منوی جعبه ابزار به جای منوی View و یک دکمه به نام راه اندازی است که به ارمغان می آورد تا این ابزار به نوار ابزار اضافه شده است در بر داشت.

در تجزیه و تحلیل هم اکنون می توانید بر روی عناصر داده ها در جدول نتایج یک جستجوی محلی ذکر شده با انتخاب عناصر مورد علاقه، راست کلیک کردن با ماوس و مرور از طریق منوی زمینه که به نظر می رسد راه اندازی می شود.



در و nbsp؛


متاداده

در و nbsp؛

در
& nbsp؛ یک & nbsp؛ در "حذف انجمن (ها)" گناه گزینه برای از بین بردن انجمن ابرداده از عناصر داده های انتخاب شده اضافه شده است از نظر عناصر ابرداده در منوی کلیک راست زمینه.

در فراداده یافتن آسوشیتد داده مشاهده آن در حال حاضر نیز امکان استفاده از جستجوی در ناوبری منطقه که ردیف های متعدد انتخاب می شوند.



در هنگام وارد کردن ابرداده از یک صفحه گسترده با فرمول در آن، نتیجه ارزیابی از فرمول (به عنوان در اکسل نمایش داده) در حال حاضر به جای فرمول خود وارد شده است.

در و nbsp؛


عمومی

در همه ارتباطات سرور NCBI در حال حاضر رمزگذاری شده است. (NCBI خواهد شد در حال حرکت همه خدمات وب به پروتکل HTTPS در تاریخ 30 سپتامبر 2016) و nbsp؛



در این لیست از آنزیم از پیش نصب شده در میز کار و nbsp؛ از REBASE روز شده است



در گزینه "در لیست نیست" شده است به عنوان یک گزینه جدول فیلتر جدید معرفی شده است.



در جزئیات گروه بخوانید در حال حاضر در نمایش عنصر اطلاعات از لیست ترتیب نشان داده شده.



در بانک ژنی واردات در حال حاضر نیز اجازه می دهد تا برای نام فایل ها با پسوند GBFF.



در "مرتب سازی بر پوشه" ابزار در حال حاضر با استفاده از مرتب سازی عددی برای نام پرونده با پیشوند یک عدد است.

در
متغیرهایی جدید زمانی که تعریف نامهای از خروجی صادر کننده در دسترس هستند: & nbsp؛ در {برای کاربران}، و nbsp؛ {میزبان}، و برای عناصر زمان از جسم خروجی، {سال}، و nbsp؛ {ماه}، و nbsp؛ {روز}، و nbsp؛ {ساعت، و nbsp؛ {دقیقه}، و nbsp؛ . {دوم} و nbsp؛
متغیرهایی درون نام خروجی صادرات که قبلا فقط به عنوان رقم هم اکنون می توانید با استفاده از نام نوشته شده است مشخص شدند: {ورودی} مترادف برای {1}، {پسوند} مترادف برای {2} و {ضد} است مترادف برای است { 3}.

در چه در نسخه 7.7.1 جدید است:



ثابت است که شماره به وجود آمد که اجرای گردش کار با ورودی های متعدد در دسته ای، که در آن تغییرات از پیش تعریف شده، ورودی ثابت مشخص و در طول فرآیند راه اندازی اعمال نمی شد.
ثابت که در آن از ابزار موتیف جستجو نادرست گزارش همه دقت بازی به صورت 0٪ یا 100٪.
ثابت که در آن موضوع مرتب سازی یک پوشه در حالی که صرفه جویی در به بود، اشتباه را آغاز کند.
رفع اشکال در دسته ای گفت و گو حالت که به خطا منجر وقتی که مشکلات مربوط به فایل ها و یا داده های مکان زمینه ای مواجه نشدند.

در چه در نسخه 7.7 جدید است:

در واردات متاداده - پایه و آسان واردات ابرداده. این ابزار مکمل ابزارهای موجود در پرونده جدول ویرایشگر.

در چه در نسخه 7.6.4 جدید است:

رفع اشکال

رفع اشکال در هنگام جستجو برای توالی در ابزار NCB موفق به دانلود توالیهای نوکلئوتیدی با پیام خطا "توالی زیر را به درستی دریافت نشده است.
ثابت مشکل با این انفجار در گام NCBI از درست پروتئین را گزارش ابزار است.
ثابت موضوع منجر به خطا در صادرات VCF که در آن داده های درگیر در اصل از فایل های VCF وارد شده است و ارزش در زمینه QUAL اعداد صحیح بودند و nbsp؛
صادرات ممیز شناور (اعشاری) اعداد به VCF & nbsp؛ در فرمت قبلا وابسته به زبان محلی تعیین شده بود. این ثابت شده است به طوری که به & nbsp؛ جداکننده اعشاری & nbsp؛ در حال حاضر همیشه یک نقطه است.
هنگام انجام ارتباط خودکار فراداده، ورود به سیستم در حال حاضر نشان می دهد که متاداده ردیف با هر گونه اطلاعات مرتبط نشده است.
رفع اشکال که مانع این اطلاعات را دستی فراداده به از درون میز کار دیده می شود.
رفع اشکال که در انجام ارتباط خودکار و با استفاده از یک جدول فرادادههای ذخیره شده در سرور CLC شکست خواهد خورد.
انجمن خودکار فراداده در حال حاضر دسته ارتباط بر اساس یک پیشوند نام داده و نه و دقیق تطبیق به کل نام داده است.

یک جدول فرادادههای دیگر نیاز یک ستون کلیدی برای ردیف خود را به صورت دستی با عناصر داده است.
یک گزینه به نادیده گرفتن نقش فراداده قبلا در تنظیمات خروجی گردش کار قابل مشاهده، حذف شد.
ثابت خطا اتفاق می افتد زمانی که یک میز کار داده های مکان در یک فایل بر روی سیستم به جای یک پوشه اشاره می کرد. حالا به عنوان میز کار در منطقه کنترل در دسترس نیست به نظر می رسد.
نکات راهنمای ابزار را فعال کنید برای تمام پارامترهای زمانی که پیکربندی و اجرای گردش کار.
فرایند ورود از یک میز کار به یک سرور CLC در حال حاضر باید قبل از باز کردن یک URL CLC آغاز خواهد شد کامل است.
رفع مشکل در مکینتاش که در آن میز کار به عنوان یک کنترل پروتکل های سفارشی برای CLC رسمیت شناخته نشده بود: // URL ها.
حل و فصل یک استثنا رخ نادر است که می تواند با تغییر نظر ویرایشگر با دوبار کلیک کنید باعث شده است.

در چه در نسخه 7.6.3 جدید است:

در ویژگی های جدید و بهبود

در
مقدار مصرف رژیم در عناصر انتخاب شده در حال حاضر امکان: از آن استفاده می به پوشه های انتخابی محدود شود.
هم اکنون می توانید "EST" را به عنوان پایگاه داده در هنگام استفاده از جستجو برای دنباله در ابزار NCBI را انتخاب کنید.
نظام سلسله مراتبی خوشه ابزار نمونه هم اکنون می توانید به عنوان بخشی از گردش و بر روی سرور اجرا می شود.
بهبود مدیریت حافظه در هنگام مدیریت عناصر گزارش بزرگ است.
نکات راهنمای ابزار در برگ درخت فیلوژنتیک در حال حاضر نمایش توضیحات از دنباله متصل شده است.
اعداد دیگر به نام عناصر گردش کار اضافه در هنگام ایجاد یک کپی از یک گردش کار با استفاده از "باز کردن کپی از گردش کار".
مدیریت ابرداده. آهنگ از فایل های ورودی را نگه دارید و وارد کردن اطلاعات متا برای نمونه خود را.

در رفع اشکال

ثابت موضوع رخ نادر که در آن میز کار باید یک پیام خطا نمایش در هنگام نصب یک پلاگین مجوز 3rd حزب.
ثابت که در آن انتخاب یک ورودی در یک جدول نتایج انفجار می تواند تراز اشتباه در ویرایشگر انفجار اگر جدول فیلتر شده و یا طبقه بندی شده اند شده بود برجسته.
ثابت که در آن موضوع کلیک کردن بر روی یک حاشیه نویسی در ویرایشگر آغازگرها طراحی می تواند منجر به یک پیغام خطا می دهد.
ثابت که در آن حاشیه نویسی است که به پایان می رسد از یک توالی دایره میرسد می شود به اشتباه در دنباله نمایش مدور قرار داده است.
رفع اشکال که ناشی از میز کار به مسدود اگر توالی خاصی در نظر دایره ای با رندر شعاعی برچسب نمایش داده شد.
گزارش صادر ثابت داشتن نویسنده اشتباه در شرایط خاص.
ثابت موضوع موجب آن درست نمودار جعبه و آنالیز اجزای اساسی گاهی اوقات می تواند با استدلال غیر قانونی اجرا می شود، منجر به یک پیغام خطا.
خروجی از ابزار معکوس مکمل توالی حال حاضر می شود -RC پسوند متصل به نام ورودی به جای -1 قبل از.
رفع اشکال در پیش بینی ساختار دوم ابزار زمانی که این گزینه برای محاسبه تابع پارتیشن برای مولکول های طولانی (& gt؛ به 1000 نوکلئوتید) انتخاب شد.

در مسئله که در آن یک نفر می تواند پس از زوم کردن به طور کامل در گردش بسیار بزرگ زوم.
ثابت است که شماره یک پوشه ریشه بر روی درایوهای ویندوز از اینکه به عنوان یک فایل محل سکونت مورد استفاده قرار جلوگیری کرد.
ثابت که در آن به روز رسانی نصب موجود بر روی ویندوز در فایل .vmoptions منجر به حذف، که باعث می شود میز کار اجرا با پیش فرض تنظیمات جاوا.

در چه در نسخه 7.6.2 جدید است:

رفع اشکال

اضافه شدن یک کار در اطراف به یک مسئله جاوا است که گاهی اوقات در میز کار منجر نمایش خطا بیارزش و نیاز به راه اندازی مجدد برای ادامه کار.
ثابت موضوع را با در حال اجرا انفجار در NCBI که در آن یک خطا NCBI تولید در مورد محدودیت استفاده از CPU خود را که بیش از حد شد منتشر نمی شفاف و یک نتیجه از "هیچ بازدید" به جای گزارش شد.
ثابت برای جلوگیری از یک استثنا در شرایطی که پاکسازی فایل های دانلود شده از انفجار شکست خورده استفاده شد.
ابزار معکوس ترجمه نادیده گرفته هر کد ژنتیکی مشخص شده در جداول فراوانی کدون. همه ترجمه معکوس در نتیجه به کد ژنتیکی استاندارد طور پیش فرض.
در هنگام نصب یک گردش کار با داده های همراه، آن است که دیگر نمی توان به انتخاب یک پوشه فقط خواندنی برای ذخیره سازی داده ها.
ثابت نمایش اشتباه "فرمت های پشتیبانی شده" زمانی که صادرات عناصر از هر دو ویرایشگر پوشه و یا محلی ویرایشگر جستجو.
ثابت از فایل بالقوه اشتباه بودن نجات داد هنگامی که ویرایش یک فایل پیدا شده است از طریق ویرایشگر جستجوی محلی.
توطئه در داخل گزارش در حال حاضر با تنظیمات پانل سمت ذخیره شده خود نشان داده.
ثابت صرفه جویی رنگ خط های مختلف در توطئه از طریق پنل سمت.

در پنل های موجود جانبی را نشان می دهد افسانه برای یک طرح با بیش از 10 نمونه در حال حاضر فعال.
ثابت است که شماره منجر به خطا در هنگام رندر توطئه برای مجموعه داده های خالی است.
ثابت است که شماره که در آن "خالی کردن سطل بازیافت" گزینه گاهی اوقات به اشتباه در دسترس نبود.

در چه در نسخه 7.6.1 جدید است:


ویژگی های جدید و بهبود

صادر کننده GTF است در حال حاضر برای میز کار اصلی در دسترس.
آزمایش ترانس و جداول نمونه هم اکنون می توانید طبقه بندی شده اند می شود، حتی با تعداد زیادی از ردیف.
بهبود اکسل، HTML و تب تحدید صادرات انواع (را انتخاب کنید تنها حاشیه نویسی / ستون شما نیاز دارید).

رفع اشکال

ثابت خطا موثر بر "کات دنباله قبل / پس از انتخاب" ابزار در ویرایشگر شبیه سازی.
اشکال ثابت که در آن یک سمت چپ کلیک کنید به سرعت با راست کلیک به دنبال به عنوان دوبار کلیک بر روی OS X تفسیر شد (در لیست نتایج جستجو پشتکار، در درخت جعبه ابزار، و در ویرایشگر گردش کار).

در چه در نسخه 7.6 جدید است:

ویژگی های جدید و بهبود

آهنگ های:

خروجی سازگار وقتی غنی سازی آهنگ نوع و آهنگ های حاشیه نویسی با ستون های جدول فوق العاده است. آهنگ های خروجی از این ابزار در حال حاضر به همان تعداد از ستون های جدول را اضافه نموده و ستون همیشه در همان جهت خواهد بود. پیش از این، اگر یک ستون اضافه ارزش خالی برای تمام ردیف نوع حال، آن را از جدول نهایی حذف شده است، در تعداد و ترتیب نسبی ستون های اضافی که نمونه های متعدد را با همان ابزار / گردش پردازش شد متفاوت می شود. تمام ستون در حال حاضر حفظ، تسهیل پردازش پایین دست از جداول صادر شده، و ارائه مرجع فوری بصری که به عنوان ابزار غنی سازی / حاشیه نویسی استفاده شده است، حتی اگر آنها هیچ نتیجه تولید برای یک نمونه خاص نیست.
استفاده از جدول برای آهنگ های مختلف و آهنگ های حاشیه نویسی هم اکنون می توانید مرتب کردن و ستونها فیلتر با سلول های حاوی شماره های متعدد.
بهبود بیننده مسیر برای متغیر آهنگ برای نشان دادن تغییر توالی در نوع ارائه شده است.
آهنگ های نمودار در حال حاضر مقادیر منفی را پر به سمت بالا به = Y 0 (عنوان انتظار می رود) نشان می دهد.

در اعشار افزایش برای اعداد زمانی که صادرات جدول به CSV، تب تحدید متن، و اکسل.
گزارش بهبود یافته از خطاهای مربوط به فضای دیسک کم است.


در چه در نسخه 7.5.1 جدید است:

در

در حال حاضر امکان برای اجرای یک گردش کار بدون ورودی اختیاری است.
ابزار AAC را انواع در 3 'UTR با تغییر سطح DNA خود را با استفاده فرمت HGVS c.xxx حاشیه نویسی است. این تجزیه و تحلیل از versons قدیمی تر انجام می شود با GX 7.5 و یا بر اساس زودتر بر روی سی دی آهنگ های ENSEMBL تاثیر می گذارد. تجزیه و تحلیل AAC باید با استفاده از GX 7.5.1 برای حاشیه نویسی درست دوباره.
اشکال فیلتر Pfam ثابت شده است. پیش از این، Pfam تنها دامنه از هر نوع در یک پرس و جو و به عنوان یک نتیجه بسیاری از حوزه از دست رفته بودند گزارش شده است. ما توصیه می کنیم که کاربران که تحقیق بستگی به حاشیه نویسی Pfam دوباره اجرا از ابزار در داده های خود.
رفع اشکال در 'حداکثر تکامل نژادی احتمال' ابزاری است که شکست خورده در هنگام تولید ارزش خود راه انداز برای صف ورودی خاص.
حل مشکل با اسکرول به فایل های مربوطه در هنگام انتخاب اشیاء به عنوان پارامتر در جادوگران ابزار است.
نتایج متن انفجار بهبود یافته است به طوری که آنها پرس و جو درست و موضوع مورد نشان صرف نظر از رشته.
ثابت مشکل است که در هنگام انتخاب برای اجرای این بر روی سرور CLC عملیات BLAST جلوگیری کرد.
در حال حاضر امکان برای اجرای یک گردش کار بدون ورودی اختیاری است.

نرم افزار های مشابه

Pathomx
Pathomx

22 Nov 14

Orbit3d
Orbit3d

4 Jan 15

CrystalDiffract
CrystalDiffract

18 Jun 18

نرم افزار های دیگر از توسعه دهنده CLC bio

نظرات به CLC Main Workbench

نظر یافت نشد
اضافه کردن نظر
روشن کردن تصاویر!
جستجو بر اساس طبقه بندی