در گسترش بابل منبع باز، همکاری، رایگان و multiplatform نرم افزار کتابخانه است که طراحی شده است تا به عنوان یک جعبه ابزار شیمیایی به خصوص مهندسی به رسمیت شناختن زبان های متعدد از داده شیمیایی عمل است. این است که به سادگی دوبله صفحه & ldquo؛ گسترش شیمی جعبه ابزار کار & rdquo؛ ویژگی در یک glanceWith گسترش بابل، کاربران قادر خواهند بود به جستجو، تجزیه و تحلیل، تبدیل، و ذخیره داده ها از شیمی، مدل سازی مولکولی، بیوشیمی، و همچنین سایر مناطق مرتبط. این پشتیبانی از طیف گسترده ای از فرمت های فایل های شیمیایی معمول، از جمله Mol2، SDF / MOL، PDB، XYZ، لبخند، و CML.
علاوه بر این، گسترش بابل فراهم می کند پشتیبانی جعبه ابزار، MIME شیمیایی یک برنامه نویس کامل برجسته است، نشانهای تطبیق، اتم انعطاف پذیر / typer باند، حذف هیدروژن و علاوه بر این، bitvector کلاس، ماتریس و بردار تحولات، و همچنین به عنوان یک suite.Under آزمون مولکولی هود و پشتیبانی عامل systemsOpen بابل به طور کامل در C ++ زبان برنامه نویسی نوشته شده است. این برون SA واقعی نرم افزار کراس پلت فرم که گنو / لینوکس، BSD، سولاریس، SGI، مایکروسافت ویندوز و سیستم عامل Mac OS X را پشتیبانی می کند. هر دو 32 بیتی و 64 بیتی کامپیوتر به طور رسمی در زمان نوشتن this.Getting با گسترش BabelFirst از تمام موضوعات آغاز حمایت، ما به شدت به شما توصیه به نصب گسترش بابل با استفاده از بسته های باینری از پیش ساخته شده از مخازن نرم افزار به طور پیش فرض از شما توزیع لینوکس است. اگر سیستم گنو / لینوکس خود را ندارد و برون تی نرم افزار گسترش بابل در پروژه خود را، و سپس شما برون خواهید باید کامپایل و نصب و راه اندازی نرم افزار با استفاده از منابع جهانی آرشیو در Softoware ارائه شده است.
دانلود بسته (بایگانی تار. gz)، استخراج آن را در یک مکان از انتخاب شما، باز کردن یک شبیه ساز ترمینال، حرکت به پوشه استخراج و اجرای روی دکمه & ldquo؛ cmake کار & rdquo؛ فرمان (بدون نقل قول) به پیکربندی پروژه می باشد. سپس، شما باید دویدن روی دکمه & ldquo؛ را کار & rdquo؛ فرمان، بدون نقل قول، البته، آن را کامپایل. لطفا مطمئن شوید که ابزار CMake در نصب شده بر روی سیستم عامل خود را قبل از دستورالعمل بالا
چه در این نسخه جدید است.
این آزادی نشان دهنده یک اشکال ثابت انتشار عمده و باید ارتقاء پایدار، به شدت برای تمام کاربران از گسترش بابل توصیه می شود. بسیاری از اشکالات و پیشرفت در سال گذشته از 2.3.0 نسخه اضافه شده است.
جدید در نسخه 2.2.2 است:
در این نسخه نشان دهنده انتشار عمده اشکال ثابت و ارتقاء ثبات، به شدت برای تمام کاربران از گسترش بابل توصیه می شود. در حالی که ممکن است وجود داشته باشد بسیاری از ویژگی های جدید نیست، بسیاری از تصادفات و دیگر اشکالات اند از 2.2.1 برطرف شده است.
به روز رسانی به جدید InChI 1.02 آزادی برای تولید استاندارد InChI و InChIKey خروجی.
ثابت بسیاری از اشتباهات فضایی هنگام خواندن / نوشتن لبخند می زند. این بخشی از یک پروژه بزرگتر خواهد شد که در 2.3 انتشار به پایان رسید.
مجموعه ثابت و نصب بر روی از Cygwin و MinGW سیستم عامل.
قابل توجهی بهبود یافته آروماتیک و انتساب باند ککوله (دهانه).
بهبود 2D - & gt؛ به 3D نسل هماهنگ
بهبود هماهنگی نسل با استفاده از --gen3d عملیات خط فرمان
عملکرد بهبود یافته برای هماهنگی نسل.
جدید --fillUC عملیات خط فرمان برای بابل.
رفع به وابسته به pH هیدروژن علاوه بر.
اضافه شدن پشتیبانی برای خواندن داده ارتعاشی از فایل های خروجی Molden، Molpro، و NWChem.
به روز شده شعاع اتمی از محاسبات نظری اخیر.
ثابت اشکال هنگام خواندن Mol2 یا فایل های XML-از gzip فشرده.
بستن فایل های پس از خطا. رفع اشکال با Pybel که در آن فایل های را باز باقی می ماند.
بسیاری از رفع اشکال بیشتر و بهبود ویژگی های کوچک است. == فرمت فایل جدید == واردات و صادرات:
ورودی Molpro و خروجی.
VASP هماهنگ فایل (CONTCAR و POSCAR).
جدید در نسخه 2.2.1 است:
در رابط برنامه نویسی پیشرفته، از جمله پشتیبانی از پایتون 3 و بهبود جاوا و C # پشتیبانی می کند.
اضافه شدن پشتیبانی از اثر انگشت MACCS. با تشکر از پروژه RDKit.
بسیاری از رفع و پیشرفت به کد درست نیروی. به طور خاص، UFF اجرای درست نیروی باید بسیاری از مولکول های بیشتری را تحمل کنند.
بهبود 3D نسل هماهنگ، به خصوص با قطعات حلقه. شما می توانید این را امتحان کنید با ابزار obgen می دهد.
ثابت انواع خطاها واردات PDB با انواع اتم.
اضافه شدن پشتیبانی از خواندن اتهامات و شعاع از فرمت های فایل PQR.
اضافه شدن پشتیبانی از سلول های خواندن و نوشتن واحد در فرمت PDB.
جدید & quot؛ خروجی ها & quot؛ فرمت فایل برای گرفتن عمومی & quot؛ را .out & quot؛ باشد و & quot؛ شوید. & quot؛ باشد و & quot؛. DAT و & quot؛ فایل ها و خواندن با نوع فایل مناسب بر اساس مطالب. در حال حاضر کار می کند بسیار خوب برای بسته شیمی کوانتومی.
اضافه شده بهبود رفع خطا و گزارش زمانی که قادر به بارگیری فرمت های فایل.
بهبود CIF پشتیبانی از فرمت فایل.
بسیاری از، بسیاری از، بسیاری از رفع اشکال اضافی و پیشرفت های کوچک است.
نظر یافت نشد