در سوئیس-PdbViewer (با نام مستعار DeepView) نرم افزار فراهم می کند که یک رابط کاربر پسند اجازه می دهد به تجزیه و تحلیل پروتئین چند در همان زمان است. پروتئین ها می تواند به منظور استنتاج صف ساختاری و مقایسه سایت های فعال خود و یا هر قسمت مربوطه دیگر سوار شود. جهش آمینه اسید، H-اوراق قرضه، زاویه و فاصله بین اتم های آسان برای به دست آوردن لطف بصری رابط گرافیکی و منو.
سوئیس-PdbViewer (با نام مستعار DeepView) شده است از سال 1994 توسط نیکلاس Guex توسعه یافته. سوئیس-PdbViewer است محکم به SWISS-مدل، سرور خودکار مدل سازی همسانی توسعه در موسسه سوئیس بیوانفورماتیک (SIB) در بیوانفورماتیک گروه سازه در Biozentrum در بازل مرتبط است.
کار با این دو برنامه تا حد زیادی کاهش می دهد مقدار کار لازم برای تولید مدل، آن را به عنوان ممکن است به موضوع توالی اولیه پروتئین بر روی یک قالب 3D و دریافت بازخورد فوری از اینکه چگونه به خوبی از پروتئین رشته ای خواهد بود قبل از ارسال درخواست برای ساخت حلقه گم شده و اصلاح بسته بندی sidechain پذیرفته شده توسط ساختار مرجع.
سوئیس-PdbViewer همچنین می توانید نقشه چگالی الکترونی به عنوان خوانده شده، فراهم می کند و ابزار های مختلف برای ساخت به تراکم. علاوه بر این، ابزار مدل سازی های مختلف فایل های یکپارچه و فرمان برای بسته به حداقل رساندن انرژی محبوب را می توان تولید می شود.
در نهایت، به عنوان یک جایزه ویژه، صحنه POV-ری را می توان از نمای فعلی به منظور ایجاد اشعه ترسیم تصاویر با کیفیت خیره کننده تولید
چه جدید در این نسخه است.:
اتم تیمین C6 در حال حاضر به درستی لود
ثابت خروجی حلقه بی پایان POV-ری در نسخه PC
تصادف گاه به گاه در حالی که صرفه جویی در فایل های PDB (مانند 2i37) بر روی کامپیوتر برطرف شده است
به روز شده در آدرس از اوپسالا الکترون تراکم نقشه وب
نظر یافت نشد