NeuronVisio

نرم افزار تصویر:
NeuronVisio
جزئیات نرم افزار:
نسخه: 0.8.6
ها تاریخ: 20 Feb 15
توسعه دهنده: Michele Mattioni
پروانه: رایگان
محبوبیت: 28

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

در NeuronVisio با نورون با استفاده از رابط پایتون نورون جدید متصل می شود.
نصب و راه اندازی:
برای نصب NeuronVisio شما نیاز به برآورده وابستگی زیر
و nbsp؛ * پایجیتیکی
و nbsp؛ * بصری
و nbsp؛ * کتابخانه متپلات
نصب آسان
ساده ترین راه برای دریافت neuronvisio است اگر شما setuptools نصب:
easy_install neuronvisio
بدون setuptools، آن را هنوز هم بسیار آسان است. دانلود فایل neuronvisio.tgz از صفحه Cheeseshop neuronvisio است، untar آن و اجرا:
پایتون setup.py نصب
مستندات
مستندات موجود در پوشه توضیحات و یا آنلاین است.
شروع سریع
این کد فقط به دادن یک ایده در مورد چگونگی استفاده از ماژول nrnvisio:
1. آتش تا کنسول ipython با سوئیچ pylab:
& nbsp؛ در ipython -pylab # در صورتی که شما سوئیچ استفاده نمی کنید و هیچ نوع نمودار را ببینید.
2. واردات ماژول:
& nbsp؛ از neuronvisio.controls وارد کنترل
& nbsp؛ در گروه شاهد = شاهد ()
هنگامی که nrnvisio آغاز شده است موضوع راه اندازی شده است. در این موضوع تمام روند nrnvisio بدون مسدود کردن کنسول اتفاق می افتد.
به عنوان یک مثال سریع از کد زیر:
و nbsp؛ 1. ایجاد یک بخش تک به نام سوما
و nbsp؛ 2. درج یک کانال Hodgkey-هاکسلی و هدایت منفعل
و nbsp؛ 3. درج یک alphaSynapse به ارائه stimul.
به عنوان مثال سریع می تواند به شرح زیر است ::
از کنترل nrnvisio.controls واردات
کنترل = شاهد () # شروع GUI
از واردات نورون ساعت # گرفتن HocInterpreter
سوما = h.Section () # ایجاد یک بخش
soma.insert ('HH) # قرار دادن یک کانال HH
soma.insert ('پاس') # قرار دادن هدایت منفعل
SYN = h.AlphaSynapse (0.5، ثانیه = سوما) ورودی # سیناپسی
syn.onset = 0.5 # هنگامی که به آتش
syn.gmax = 0.05 # رسانش از سیناپس
syn.e = 0 # بالقوه برگشت
به عنوان مثال بیشتر در نمایش مثال دایرکتوری نحوه استفاده از Neuronvisio با مدل پیچیده تر

ویژگی ها:.

تجسم 3D مدل با امکان تغییر آن در زمان اجرا
ایجاد بردار برای ضبط هر متغیر در حال حاضر در بخش
ادغام Pylab به رسم مستقیم در نتیجه از شبیه سازی
اکتشاف از timecourse از هر متغیر در میان زمان با استفاده از مقیاس رنگی
رابط کاربری گرافیکی اجرا می شود در موضوع خود را پس از آن امکان استفاده از کنسول (ipython به شدت پیشنهاد)

مورد نیاز:

پایتون

نرم افزار های مشابه

OpenDX
OpenDX

2 Jun 15

iceWing
iceWing

20 Feb 15

Impact
Impact

14 Apr 15

نظرات به NeuronVisio

نظر یافت نشد
اضافه کردن نظر
روشن کردن تصاویر!