در سیستم E-همراه یک مفهوم ساخت سلول های مجازی بر روی کامپیوتر است.
سیستم E-همراه-شی گرا مجموعه نرم افزار برای مدل سازی، شبیه سازی و تجزیه و تحلیل سیستم های پیچیده در مقیاس بزرگ مانند سلول های بیولوژیکی، معماری توسط Kouichi تاکاهاشی و نوشته شده توسط یک تیم فوق العاده از توسعه دهندگان است. بخشی از هسته سیستم، E-همراه شبیه سازی محیط زیست نسخه 3، اجازه می دهد تا بسیاری از اجزای با بازه های زمانی مختلف به همزیستی رانده شده توسط الگوریتم های متعدد.
پروژه E-همراه یک پروژه تحقیقاتی بین المللی با هدف توسعه حمایت نظری لازم، فن آوری و سیستم عامل نرم افزار اجازه می دهد تا شبیه سازی سلول دقیق کل است.
سیستم E-همراه متشکل از سه بخش عمده زیر است:
- E-همراه شبیه سازی محیط زیست (یا E-همراه SE)
- E-همراه مدل سازی محیط زیست (یا E-سلول ME)
- E-همراه جعبه ابزار تحلیل
ویژگی ها:
به قابلیت های عمومی:
مدل سازی شی گرا و شبیه سازی سیستم های پیچیده است.
افزونه معماری. کلاس های کاربر شی جدید را می توان توسعه یافته، به صورت پویا بارگذاری می شود، و مورد استفاده در شبیه سازی.
زمان واقعی تعامل با کاربر و تجسم در طول شبیه سازی.
برنامه نویسی:
برنامه نویسی پایتون از یک جلسه شبیه سازی (دستکاری راه اندازی / توقف / پارامتر / پردازش داده ها و غیره ...).
برنامه نویسی پایتون از یک آزمایش شبیه سازی است که شامل بسیاری از اجرا می شود از جلسات شبیه سازی (مانند تنظیم پارامتر، تجزیه و تحلیل کنترل متابولیک و غیره.)
برنامه نویسی پایتون نسل فایل مدل (به عنوان مثال برای ساخت و ساز مدل خودکار از پایگاه داده).
Compatibilities:
سطح SBML 1/2 واردات.
سطح SBML 1/2 صادرات.
محاسبات موازی:
حافظه اشتراکی، موازی چند موضوع از یک جلسه شبیه سازی واحد. (به شاخه اصلی با هم ادغام شدند.)
خوشه و شبکه محاسبه جلسات متعدد شبیه سازی توزیع شده است. یکشنبه گرید موتور، (ابزار بغض در گلو).
به چه چیزی جدید در این نسخه است:
این نسخه اضافه می کند رفع اشکالات مختلف است.
به چه جدید در نسخه 3.1.107 RC2 است:
در ecell.Session.saveLoggerData رفع اشکال (). (Moriyoshi)
رفع اشکال در ecell.ECDDataFile. (Moriyoshi)
به چه جدید در نسخه 3.1.107 RC1 است:
حل مشکل تلفیقی در شورای همکاری خلیج فارس جدیدتر (& gt؛ به = 4.3). (Moriyoshi)
pyecs یکپارچه را به pyecell. (Moriyoshi)
ecell.emc ادغام ecell.ecs برای جلوگیری از غرابت انتساب دهنده اولیهی استاتیک در برخی از پلت فرم (از جمله سیستم عامل مک X). (Moriyoshi)
دو ظاهر GUI (جلسه مانیتور و مدل سردبیر) تمدید شد دو بسته از ماژول های پایتون، ecell.ui.osogo و ecell.ui.model_editor. (Moriyoshi)
GtkSessionMonitor نقل مکان کرد به ecell.ui.osogo.GtkSessionMonitor که در ecell / ظاهر / session_manager ساکن. (Moriyoshi)
ecell.SessionManager تغییر نام داد به ecell.session_manager. (Moriyoshi)
ثابت های زیر از ecell.ecs_constants حذف شده است. (Moriyoshi)
نظر یافت نشد