مهر ماژول پایتون فراهم می کند که توالی در Hadoop است.مهر و موم از نگاشتکاهش برنامه برای توالی بیولوژیکی است. این در Hadoop (http://hadoop.apache.org) از طریق Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net)، API پایتون نگاشتکاهش و HDFS برای Hadoop اجرا می شود مورد نیاز:. ...
در avalanchetoolbox جعبه ابزار برای شناسایی و توصیف فرآیندهای انشعاب، مانند بهمن عصبی است مورد نیاز:. ...
در Murka آزاد، کراس پلت فرم و نرم افزار منبع باز خط فرمان است که کمک می کند تا کاربران به راحتی حل مشکل تکامل نژادی، به سادگی با استفاده از شبکه های ماد است. این شامل روش اکتشافی، الگوریتم دقیق آن، و همچنین به عنوان یک اشتاینر حل کننده.Murka برون ورودی یک برگشت و stepmatrix ترازی، و خروجی ارائه می دهد (زیر) درختان...
در HTSeq یک چارچوب پایتون برای پردازش و تجزیه و تحلیل داده ها از توالی بالا در استفاده از (HTS) سنجش است مورد نیاز:. ...
. نارنجی-بیوانفورماتیک نارنجی بسته نرم افزار داده کاوی افزودنی را در & nbsp است؛ گسترش نارنجی با ارائه قابلیت های مشترک برای انجام دادن کارهای اساسی در بیوانفورماتیک. همچنین این ویدجت برای نارنجی بوم، که کاربرانی که در برنامه نویسان برای مدیریت میکروآسی و اطلاعات ژنومی جریان و به دلخواه تجزیه و تحلیل خود را با ترکیب...
در edittag مجموعه نرم افزار برای طراحی مجموعه ای از ویرایش برچسب ها دنباله متریک، چک کردن برچسب ها دنباله برای ترکیب به ویرایش متریک، و یکپارچه سازی برچسب ها دنباله به آداپتورهای آنان تعیین توالی پلت فرم خاص و آغازگر PCR است. edittag متفاوت از روش های دیگر:و nbsp؛ * edittag تولید طول دلخواه از تگ های دنباله ویرایش...
پروژه VULCAN تجزیه و تحلیل دینامیک سیالات محاسباتی فراهم می کند.VULCAN (ویسکوز خلاف جهت باد الگوریتم برای تجزیه و تحلیل جریان مجتمع) ارائه می دهد دینامیک سیالات محاسباتی برای سرعت مادون صوت از طریق آشفته مافوق صوت واکنش و غیر واکنش جریان بر روی انواع سیستم عامل های محاسباتی موازی و سریال و.هزینه محاسباتی تجزیه و تحلیل...
در seriesoftubes خط لوله طولانی برای Solexa داده تراشه SEQ است.مستندات بسته بندی در مورد نیاز:...
در reciprocal_smallest_distance یک الگوریتم orthology دو به دو که با استفاده از توالی جهانی و حداکثر احتمال فاصله تکاملی بین توالی به دقت تشخیص orthologs بین ژنوم است.نصب از طریق بستهدانلود و untar آخرین نسخه از گیتهاب:سی دی ~-L حلقه...
سیستم مانند را ساخت اغلب مورد استفاده برای ایجاد گردش کار پیچیده، به عنوان مثال در بیوانفورماتیک و nbsp؛ هدف snakemake برای کاهش پیچیدگی گردش ایجاد شده توسط ارائه یک دامنه به زبان مدرن و تمیز خاص مشخصات (DSL) در سبک پایتون، همراه با یک محیط اعدام سریع و راحت است.نصب- در اوبونتو 12.04، شما می توانید بسته دبیان...
