جدید بیوانفورماتیک برای Linux
پروژه Geant4 ابزار برای شبیه سازی از گذشت ذرات از طریق ماده است.زمینه های کاربرد آن عبارتند از فیزیک انرژی بالا و آزمایش های هسته ای،، شتاب دهنده و فیزیک فضا مطالعات پزشکی چه در این نسخه جدید است. مدل جدید از فعل و انفعالات هسته ای گاما با استفاده از Bertini آبشار اضافه شد.مدل Bertini برای pi-، K-، و Sigma- برای...
در این پروژه STEME زندگی به عنوان یک تقریب به الگوریتم انتظار-Maximisation برای نوع مدل مورد استفاده در یاب موتیف مانند الگوی رفتاری آغاز شده است.STEME برون تقریب EM اجرا می شود منظور از قدر سریع تر از اجرای الگوی رفتاری برای تنظیمات پارامتر معمولی. STEME در حال حاضر به یک یاب موتیف تمام عیار در حق خود توسعه یافته...
در Genepidgin مجموعه ای از ابزار پایتون که در نام محصول ارزیابی و ژن انتساب کمک است را لمس کنید و. سه مولفه اصلی وجود دارد.:genepidgin * * * * * * * * پاک کن& nbsp؛ در استاندارد نام ژن در دستورالعمل نامگذاری UNIPROTgenepidgin * * * * * * * * مقایسه& nbsp؛ از دو یا چند مجموعه از نام ژن مقایسهgenepidgin * * * * * * * *...
در کپسید یک پلت فرم جامع منبع باز است که ادغام یک خط لوله محاسباتی با کارایی بالا برای شناسایی توالی پاتوژن و nbsp؛ و خصوصیات در ژنوم انسان و transcriptomes همراه با یک پایگاه داده نتایج مقیاس پذیر و مبتنی بر وب نرم افزار نرم افزار کاربر پسند برای مدیریت، پرس و جو و تجسم نتایج.شروعشما یک پایگاه داده مانگودیبی نیاز،...
در MISO (مخلوط ایزوفرم) یک چارچوب احتمالاتی نوشته شده در پایتون که quantitates سطح بیان و nbsp است. ژن معادل متصل از داده های RNA-SEQ، و شناسایی ایزوفرم متفاوت تنظیم و یا اگزون در سراسر نمونه.با مدل سازی فرایند مولد است که توسط آن می خواند از ایزوفرم در RNA-SEQ تولید، مدل MISO استفاده از استنتاج بیزی برای محاسبه...
در MACS2 یک مدل مبتنی بر ابزار تجزیه و تحلیل برای داده های تراشه-SEQ است.با بهبود تکنیک تعیین توالی، immunoprecipitation کروماتین و پس از تعیین توالی عملیاتی بالا (تراشه SEQ) محبوب شدن است به مطالعه تعاملات پروتئین DNA ژنوم گسترده. برای پرداختن به عدم استفاده از روش تجزیه و تحلیل تراشه SEQ قدرتمند، ما یک الگوریتم...
در biotools یک دسته از بیوانفورماتیک آب و برق نوشته شده در پایتون است مورد نیاز:. ...
در PathVisio منبع باز و برنامه کاملا رایگان گرافیکی اجرا در زبان برنامه نویسی جاوا و طراحی از زمین تا به برای نمایش، تجزیه و تحلیل و ویرایش مسیرهای بیولوژیکی تحت عامل گنو / لینوکس مورد استفاده قرار گیرد system.Can مورد استفاده قرار گیرد به منظور جلب مسیر ، پیوند نرم افزار entitiesThe بیولوژیکی کاربران امکان می دهد به...
در Pathomx (که قبلا MetaPath) نرم افزار گرافیکی متن باز اجرا در IPython، QT و پایکیوت، طراحی از زمین تا به عنوان یک ابزار تعاملی برای تجسم و تجزیه و تحلیل داده های متابولیک در گنو / لینوکس و دیگر POSIX و nbsp عمل است. عامل سیستم های. در ابتدا مهندسی شده بود برای پردازش متابولومیکی (metabolomics) data.Features در یک...