جزئیات نرم افزار:
در MISO (مخلوط ایزوفرم) یک چارچوب احتمالاتی نوشته شده در پایتون که quantitates سطح بیان و nbsp است. ژن معادل متصل از داده های RNA-SEQ، و شناسایی ایزوفرم متفاوت تنظیم و یا اگزون در سراسر نمونه.
با مدل سازی فرایند مولد است که توسط آن می خواند از ایزوفرم در RNA-SEQ تولید، مدل MISO استفاده از استنتاج بیزی برای محاسبه احتمال این که به عنوان خوانده شده نشات گرفته از ایزوفرم خاص است.
MISO استفاده از انتساب استنباط از بار خوانده شده به ایزوفرم به quantitate فراوانی از مجموعه زمینه ای از ایزوفرم mRNA ژن های جایگزین. فاصله اطمینان بیش از برآورد می تواند به دست آمده، که تعیین قابلیت اطمینان از تخمین می زند.
لطفا http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ راهنمای MISO و اسناد را ببینید
مورد نیاز:.
پایتون
نظر یافت نشد