در سیستم معیار بیوانفورماتیک تلاش برای ساختن یک چارچوب معقول تست، آزمایش و داده ها، به کاربران نهایی قادر و فروشندگان برای بررسی عملکرد سیستم های خود می باشد.
چیزی که ما در حال تلاش برای انجام دهید این است برای ایجاد یک چارچوب برای آزمایش، و مجموعه ای از تست های هسته که همه ممکن است دانلود و استفاده به منظور بررسی عناصر خاص از عملکرد سیستم.
علاوه بر این، منبع به این آزمون تحت GPL در دسترس هستند، و در Bioinformatics.org و مقیاس پذیر انفورماتیک LLC میزبانی ایده این است که کاربران را قادر پایان، مصرف کنندگان، سیستم های توسعه دهندگان، و دیگران را به راحتی ساخت و استفاده از آزمون معنی دار به دلایل اندازه گیری و تنظیم .
جو Landman از مقیاس پذیر انفورماتیک LLC تصور ایده و کد اصلی را نوشت. ما به دنبال پیشنهادات اضافی معیار کد، آزمایش، مجموعه داده ها، و غیره
آزمون پایه کنونی چندین BLAST NCBI اجرا می شود، چندین اجرا می شود HMMer، و انواع دیگر. ما قصد داریم به شامل ClustalW، X! پشت سر هم، شیمی مختلف، پویایی، و آزمون مرتبط، و همچنین چند تن دیگر.
تست مانند LINPACK یا HPL به سادگی انجام شاخص های عملکرد معنی دار یا مدل های پیش بینی برای انفورماتیک کارایی بالا ارائه نمی دهد. متاسفانه، نه تعدادی از تست های اخیر و متمرکز شده است.
این یک مشکل به عنوان LINPACK و HPL است به طور خاص تست عملکرد در عملیات ماتریس های مختلف، جایی که شما الگوهای دسترسی به حافظه به طور موثر به طور منظم، و عملیات خاص ریاضی.
این کدها هستند مفید برای مقایسه با کد با عملیات ممیز شناور سنگین، و ترافیک حافظه در لایه. این کدها برای سیستم های جامع شد معیار، که در آن دیسک من / O، زمان تاخیر حافظه، و عوامل دیگر همه به مسائل مربوط به عملکرد کمک نمی طراحی شده است.
بهترین تست آنهایی که بیشتر شبیه به کدهای شما بر روی دستگاه را اجرا خواهد کرد هستند. آزمون خود باید تقریب معقول و منطقی به اعدام واقعی از کد خود را، با استفاده از داده های واقعی باشد. شما ممکن است نیاز به آن پشت پوست کندن به منظور رسیدن به بار واقعی اجرا شود.
شما باید یک زیر مجموعه مناسب از اندازه داده. آزمون تنها به شما نمیگوید که چگونه تعادل سیستم شما، و یکی از دلایل وجود این آزمایش به طور خاص به شما اجازه می دهد برای تست عملکرد در حالی که جنبه های مختلف از حجم کار شما را افزایش دهد.
شما به ندرت یک سیستم ساکن در یک خوشه، بنابراین ما توصیه می کنم که شما سعی می کنید به عنوان واقع بینانه در یک محیط عملیاتی که ممکن است اجرا شود. پایه در یک سیستم ساکن خوب است، اما ممکن است انتظارات خود را نامعقول تنظیم شده است.
بالا
نظر یافت نشد