در FlexS پیش بینی ترکیب و جهت گیری یکی از لیگاندهای نسبت به یک دیگر. در FlexS مرجع-لیگاند تصور می شود سفت و سخت، در نتیجه، باید آن را در یک ترکیب است که شبیه به حالت محدود شده است. الگوریتم انطباق در FlexS نیاز به مداخله کتابچه راهنمای کاربر فقط کمی. شما می توانید این دانش به محاسبات با FlexS با انجام مراحل تک دستی در اختیار دارد. بنابراین، FlexS برای کار تعاملی در جفت لیگاند و همچنین برای غربالگری مجازی مبتنی بر لیگاند طراحی شده است. دو برنامه اصلی FlexS هستند موقعیت فوق العاده لیگاند (به عنوان مثال برای CoMFA / QSAR) و غربالگری مجازی. اگر شما یک پروتئین و یک مولکول کوچک اتصال به آن (به اصطلاح مرجع-لیگاند) اما هیچ ساختار پروتئین، شما می توانید ساختار مرجع به عنوان یک اثر انگشت منفی از سایت فعال کنند. FlexS تعیین شباهت بین آزمون و ساختار مرجع با هماهنگی آنها. در غربالگری مجازی، شما یک مرجع-لیگاند و مجموعه ای از ترکیبات و شما علاقه مند در اولویت دادن به ترکیبات برای آزمایش تجربی هستند.
نظر یافت نشد