آرابیدوپسیس موتیف اسکنر (AMS) یک برنامه ویندوز است که بر روی کامپیوتر محلی اجرا می شود. از آن برای ساخت شبکه های ژنی با شناسایی موقعیت عناصر تنظیمی سیس در thaliana Arabidopsis دارد گیاهی و با ارائه یک رابط کاربری آسان برای ارزیابی و ارزیابی روابط ژن توسعه داده شد. ویژگی های عمده نوآورانه آن این است که ترکیب موقعیت عنصر تنظیمی سیس، NGS و DNA تراشه آرایه داده بیان، حاشیه نویسی آرابیدوپسیس و تعاملات ژن برای شناسایی شبکه های ژنی تنظیم شده توسط عوامل رونویسی. در مطالعات متمرکز بر عملکرد فاکتورهای رونویسی، نرم افزار با استفاده از داده بیان و صحافی نقوش سایت در مناطق ژن تنظیم کننده برای پیش بینی ژن های هدف مستقیم. علاوه بر این، با بهره گیری از AMS DNA پروتئین و تعامل proteinprotein داده برای تسهیل شناسایی از مسیرهای متابولیکی تنظیم شده توسط فاکتور رونویسی از علاقه.
نظر یافت نشد