در GenoSuite یک چارچوب توسعه برای تجزیه و تحلیل proteogenomic است. FDRScore بر اساس استراتژی استفاده می شود به ادغام نتایج حاصل از الگوریتم های جستجوی متعدد. پروکاریوتی Proteogenomic ابزار (PPT) به عنوان بخشی از چارچوب GenoSuite توسعه یافته است. PPT است برای پیدا کردن ترجمه رمان در ژنوم پروکاریوتی و وابسته به داده پروتئومیکس طیف سنج جرمی و بر اساس توالی ژنوم مرتبط است. امکانات عبارتند از 4 الگوریتم های منبع باز برای انجام پایگاه داده جستجو برای شناسایی پپتید و هر ترکیبی از الگوریتم 4 می تواند انتخاب پیکربندی، لیست کردن پپتید خاص جستجو ژنوم (پپتید رمان)، مسابقات طیفی می تواند برای ارزیابی کیفیت تجسم، لیست کردن پروتئین رمان و تغییرات در حاشیه نویسی پروتئین موجود، و زمینه ژنومی تصویری از پپتید رمان همچنین می توانید تولید می شود.
جزئیات نرم افزار:
نسخه: 2.0.1
ها تاریخ: 22 Jan 15
پروانه: رایگان
محبوبیت: 40
اندازه: 33724 Kb
نظر یافت نشد