جزئیات نرم افزار:
نسخه: 0.57
ها تاریخ: 14 Apr 15
پروانه: رایگان
محبوبیت: 2
در پاناما مدل احتمالاتی رمان به حساب عوامل مداخله گر در مطالعات eQTL، نوشته شده در پایتون است.
عوامل مداخله گر پنهان، مانند متغیرهای کمکی مشاهده نشده و یا آشفتگی محیطی دقیق ناشناخته می انجمن کاذب کاذب ایجاد و یا ماسک سیگنال های انجمن ژنتیکی واقعی است. در مقابل به روش قبلی، پاناما عوامل پنهان می آموزد به طور مشترک با اثر تنظیم کننده برجسته ژنتیکی است. به عنوان یک نتیجه، این مدل جدید با دقت بیشتری می تواند از تنوع مخدوش تشخیص سیگنال های انجمن ژنتیکی درست است.
N. Fusi، O. Stegle و ND لارنس، "مدل سازی مشترک عوامل مخدوش کننده و تنظیم کننده برجسته ژنتیکی فراهم می کند افزایش دقت در مطالعات ژنتیک ژنتیکی"، مجله PLoS محاسباتی زیست شناسی، 2012
اطلاعات بیشتر در http://ml.sheffield.ac.uk/qtl/panama.html
Requirements:
Python
نظر یافت نشد