در Staden بسته بندی مجموعه ای کامل توسعه یافته از مونتاژ توالی DNA (Gap4)، ویرایش و ابزار تجزیه و تحلیل (SPIN) برای یونیکس، لینوکس، MacOSX و MS ویندوز است.
در جبهه Gap4 چند جزئی پیوستن مرتبط وجود داشته است
بهبود در چگونه آن را نمره می پیوندد یافتن پیوندد داخلی و
عملکرد دکمه چین در تاریخ ویرایشگر.
همچنین در نتیجه به gap4 می تغییرات مختلف به io_lib (
کتابخانه برای همه I / O به فرمت های مختلف فایل ردیابی). علاوه بر این با
یک برنامه hash_exp جدید آن در حال حاضر اجازه می دهد تا برای فایل های آزمایش به
با هم متنی طولانی و نمایه میشود. لیستی از نام فایل آزمایش
باید miniscule نسبت به غرب ارائه شده به gap4، اما محیط EXP_PATH ارائه
متغیر به درستی تنظیم شده است gap4 قادر خواهد بود به بهانه های فردی
توالی از فایل متنی طولانی آزمایش
آرشیو. ارتقاء به واسط کاربر برای این هنوز هم نیاز به
ساخته شده است.
454 آرشیو SFF در حال حاضر بهتر پشتیبانی می شوند. defsult 454 شاخص
در حال حاضر کار، اگر چه برنامه hash_sff را می توان مورد استفاده برای ارائه
استراتژی نمایه سازی جایگزین (احتمالا سریع تر در برخی موارد).
Gap4 و trev نیز یکی دیگر از ردیابی سبک برای آثار صفحه نمایش است که
1 نمونه اسکن (کانال X4) در هر پایه تماس بگیرید. در این مورد می تواند
4 ارزش اعتماد به نفس به جای 1 در هر پایه نیز جلب کند. این توانایی
اجازه خواهد داد که ادغام بهتر از Solexa آثار به آسانی زمانی که بیش
در دسترس است.
البته به علاوه ترکیب معمول رفع اشکال و ترفند کوچک. مشاهده
ورود به سیستم کامل تغییر برای جزئیات بیشتر (از طریق سایت سورس).
دیگر تغییرات قابل توجه
Gap4
نظر یافت نشد