ZOOM آرشیو نسل بعدی نگاشت داده توالی و تجسم نرم افزار است. ژنوم کاربران ورودی مرجع و ایلومینا / Solexa کوتاه می خواند فایل ها و یا AB فضای رنگی جامد خواند فایل ها در فرمت های مختلف مانند * * * * .fasta، * .fastq، * _seq.txt، * .csfasta و غیره ZOOM خروجی نتایج نقشه برداری از این کوتاه بار خوانده شده در توالی مرجع. آرشیو ZOOM دارای یک هسته نقشه برداری سریع و دقیق بر اساس یک نظریه چند فاصله دانه به تازگی طراحی شده. هر دو تنها پایان و زوج پایان بار خوانده شده از طول های مختلف از 15bp به 240bp را می توان گرفته شده است. هر تعداد از عدم تطابق و یک درج / حذف طول های مختلف بین خواندن و منطقه هدف خود را در توالی مرجع مجاز است. نتایج منحصر به فرد نقشه برداری و یا بهترین (بالا N) نتایج برای هر نشانه خوانده خواهد شد با توجه به عدم تطابق حداقل و طول indel گزارش شده است. نمرات کیفیت استفاده به منظور افزایش دقت نقشه برداری. بر اساس هسته نقشه برداری، ZOOM آرشیو اجازه می دهد تا کاربران برای بارگذاری داده ها به عنوان خوانده شده محلی و مرجع اطلاعات توالی، انتخاب پارامترهای مناسب، پردازش داده ها با حجم بالا به صورت موازی در میان تا چهار پردازنده، نظارت بر وظایف در حال اجرا، ذخیره نتایج نگاشت، مشاهده نمودارهای از نتایج نقشه برداری و نقشه برداری نتایج خروجی در هر دو * * * * * * * * .BED و یا فرمت های فایل .GFF برای بیشتر نقشه برداری با UCSC اطلاعات مربوط به آهنگ مرورگر. نتایج نقشه برداری را می توان در هر مقیاس مورد نظر را برای یک کروموزوم به صف دنباله جزئیات بازدید، از گراف عمق خوانده شده بین می خواند و توالی مرجع. کاربران به راحتی به مناطق مورد نظر به سادگی از طریق کلیک کنید و بکشید و یا اسکرول حرکت. ZOOM آرشیو مشتق شده از نرم افزار ZOOM استودیو است
در چه جدید در این نسخه است:
در نسخه 1.5 شامل فرمت SAM صادرات، معماری تنظیم، بهینه سازی کد بهتر، برنامه اندازه باینری کوچکتر، و dabase به روز رسانی engining برای عملکرد بهتر است.
نظر یافت نشد