در QuasiRecomb یک برنامه بسیار سبک وزن و اجرا می شود که در کنسول فرمان، شبیه سازی یک مدل مارکوف برای تولید Quasispecies ویروسی است. آن را توصیف نسل از quasispecies ویروسی و یک روش برای پی بردن به پارامترهای آن با تجزیه و تحلیل داده های توالی نسل بعدی. مدل بر داده های شبیه سازی شده معتبر، نشان دادن استفاده از صراحت در...

در InDelFixer برنامه های جاوا برای حذف SHIFT قاب باعث اضافه و یا حذف از داده های توالی نسل بعدی است. در برخی از موارد آن شناخته شده است که پروتئین مورد علاقه ندارد انواع با شیفت قاب. این تغییرات قاب می تواند با یک ژنوم مرجع داده شده (یا ترازی چند در نسخه آینده) را اصلاح کرد. این برنامه را می پذیرد جریان استاندارد گرم...