نرم افزار تصویر:
در MACS2 یک مدل مبتنی بر ابزار تجزیه و تحلیل برای داده های تراشه-SEQ است.
با بهبود تکنیک تعیین توالی، immunoprecipitation کروماتین و پس از تعیین توالی عملیاتی بالا (تراشه SEQ) محبوب شدن است به مطالعه تعاملات پروتئین DNA ژنوم گسترده. برای پرداختن به عدم استفاده از روش تجزیه و تحلیل تراشه SEQ قدرتمند، ما یک الگوریتم رمان، به نام تحلیل بر اساس مدل از تراشه SEQ (MACS)، برای شناسایی عامل متن محل های اتصال ارائه. MACS قطاری از نفوذ پیچیدگی ژنوم برای ارزیابی اهمیت مناطق تراشه غنی، و MACS را بهبود می بخشد رزولوشن فضایی از محل های اتصال از طریق ترکیب اطلاعات از هر دو موقعیت تگ توالی و جهت گیری. MACS به راحتی می توان برای داده های تراشه-SEQ به تنهایی و یا با نمونه شاهد با افزایش ویژگی استفاده می شود،
مورد نیاز:.
پایتون
نظر یافت نشد