BioRuby

در BioRuby یک محیط یکپارچه برای بیوانفورماتیک (زیست شناسی علوم اطلاعات) را فراهم می کند.
شی گرا زبان برنامه نویسی روبی دارای ویژگی های بسیاری مناسب برای تحقیقات بیوانفورماتیک، برای مثال، نحو روشن به بیان اشیاء پیچیده، عبارات منظم برای دست زدن به متن عنوان قوی به عنوان پرل برون، طیف گسترده ای از کتابخانه از جمله خدمات وب و غیره
به عنوان نحو روبی ساده و بسیار تمیز است، ما معتقدیم که آن را آسان به برای مبتدیان یادگیری، آسان برای استفاده برای زیست شناسان، و همچنین به اندازه کافی قدرتمند برای توسعه دهندگان نرم افزار است.
در BioRuby، توسعه دهنده می تواند ورودی های پایگاه داده های بیولوژیکی از فایل های مسطح، وب سرور اینترنت و پایگاه داده های رابطه های محلی را بازیابی کنید.
این ورودی های پایگاه داده را می توان تجزیه برای استخراج اطلاعات شما نیاز دارید. توالی های بیولوژیکی می تواند با روش های انجام از روبی و ترانزیت درمان؛ S کلاس String و با عبارات منظم.
کتابخانه می تواند با ابزار مانند انفجار، از Fasta، Hmmer و بسیاری از بسته های نرم افزاری دیگر برای تجزیه و تحلیل بیولوژیکی یکپارچه شده است.
 BioRuby پشتیبانی از فرمت های عمده پایگاه داده های بیولوژیکی و فراهم می کند راه های بسیاری برای دسترسی به آنها را از طریق نمایه سازی flatfile، SQL، خدمات وب و غیره از خدمات وب سایت های مختلف از جمله KEGG API می تواند به راحتی توسط BioRuby استفاده

ویژگی ها:.

مورد نیاز:

روبی 1.8.7 و یا بالاتر