مراحل یک بسته برای شبیه سازی تصادفی دقیق سیستم واکنش انتشار در هندسه خودسرانه پیچیده 3D است. الگوریتم شبیه سازی اصلی ما اجرای SSA گیلیسپی است، توسعه یافته به مقابله با انتشار مولکول های بیش از عناصر مش چهار ضلعی 3D.
در حالی که به طور عمده برای شبیه سازی مدل دقیق از مسیرهای سیگنالینگ عصبی در دندریت ها و اطراف سیناپس توسعه داده شد، آن را به یک ابزار عمومی است و می تواند برای مطالعه هر مسیر بیوشیمیایی که در آن شیب و مورفولوژی فضایی تصور می نقش بازی استفاده می شود.
ما گام به عنوان مجموعه ای از ماژول های پایتون، که به معنی کاربران STEPS می توانید اسکریپت پایتون به کنترل تمام جنبه های راه اندازی مدل، تولید مش، کنترل شبیه سازی و تولید و تجزیه و تحلیل خروجی استفاده اجرا شده است. روال هسته محاسباتی است که هنوز هم C / C ++ ماژول فرمت برای حداکثر سرعت اعدام اجرا شده است.
مرحله تحت GPL V3 مجوز توزیع
مورد نیاز:.
پایتون
نظر یافت نشد