در PathVisio منبع باز و برنامه کاملا رایگان گرافیکی اجرا در زبان برنامه نویسی جاوا و طراحی از زمین تا به برای نمایش، تجزیه و تحلیل و ویرایش مسیرهای بیولوژیکی تحت عامل گنو / لینوکس مورد استفاده قرار گیرد system.Can مورد استفاده قرار گیرد به منظور جلب مسیر ، پیوند نرم افزار entitiesThe بیولوژیکی کاربران امکان می دهد به منظور جلب مسیر، پیوند نهادهای بیولوژیکی (پروتئین یا ژن) به داده های بیولوژیکی، با استفاده از شناسه های پایگاه داده، مسیرهای ویرایش، و همچنین به تجزیه و تحلیل مسیر. با PathVisio شما همچنین قادر خواهد بود به نقشه داده های تجربی، مانند داده های microarray، و تجسم آن را در بالای نقاشی مسیر موجود باشد.
علاوه بر این، شما قادر خواهید بود برای انتخاب یک پایگاه داده ژن، انتخاب یک پایگاه داده متابولیک، مشاهده و آمار، اطلاعات بیان واردات، مجموعه داده بیان را انتخاب کنید، مسیر جستجو، مشاهده افسانه، دستکاری اشیاء، پروژه های واردات، و همچنین برای نصب و مدیریت پلاگین ها، که می تواند قابلیت های اضافی به app.Requires هیچ برنامه installationThe را می توان بدون نصب آن بر روی سیستم عامل گنو / لینوکس خود را مورد استفاده قرار اضافه کنید. همه شما باید انجام دهید این است برای دانلود بسته های باینری از Softoware، صرفه جویی در آرشیو در یک محل از انتخاب شما، با استفاده از یک ابزار مدیر بایگانی استخراج آن، باز کردن دایرکتوری استخراج، و دوبار کلیک کنید بر روی pathvisio.jar file.Under hoodWhile مصرف یک نگاه سریع در زیر هود از نرم افزار PathVisio، ما برون ام متوجه شده است که نرم افزار به طور کامل در زبان برنامه نویسی جاوا نوشته شده است، و رابط کاربر گرافیکی خود را با آخرین فن آوری چرخش جاوا طراحی شده است. ما برون ام با موفقیت آزمایش نرم افزار بر روی کامپیوتر حمایت از هر یک از 32 یا 64 بیتی architectures.Runs CPU در هر سیستم عامل که در آن جاوا است supportedBeing نوشته شده در زبان برنامه نویسی جاوا، PathVisio می توان اعلام کرد یک برنامه مستقل از پلتفرم است که پشتیبانی از گنو / لینوکس ، مایکروسافت ویندوز، Mac OS X، BSD، سولاریس، و هر سیستم عامل دیگر که در آن از آخرین فن آوری های جاوا پشتیبانی می شوند
چه در این نسخه جدید است.
2014 ژانویه 31: انتشار رفع اشکال
نظر GeneOntology در حال حاضر از نتایج جستجو برای حاشیه نویسی حذف
DataNodes باید با ID و منبع داده یا چیزی مشروح شود (صرفه جویی در گره داده با تنها ID و یا منبع داده است دیگر مجاز نیست)
جدید در نسخه 3.1.2 است:
در اشکال عمده در ماژول واردات فایل ثابت: http://developers.pathvisio.org/ticket/1697
چه در نسخه 2.0.11 جدید است:
در ذخیره خودکار
زوم با استفاده از چرخ اسکرول
انتخاب خطوط ساده تر است: دیگر لازم هیچ به کلیک بر روی پیکسل دقیق
در حال حاضر با دو روش برای تجزیه و تحلیل بیش از حد نمایندگی؛ یک مسیر گرا و یک داده گرا
جدید در نسخه 2.0.10 است:
در راه های جدید از طراحی مستطیل برای جلوگیری از اثر کشش گرد
رفع اشکالات کوچک مختلف
جدید در نسخه 2.0.9 است:
به نوع اتصال جدید برای اتصال به طول دلخواه و زاویه دلخواه
جدید & quot؛ جزء سلولی و & quot؛ املاک برای ذخیره سازی به معنای بیولوژیکی از یک محفظه
جدید & quot؛ دو & quot؛ را نوع خط (به خصوص برای اندامکهای دو membraned مفید)
لینک قابل کلیک در مسیر
نقطه عطف ببینید: & quot؛ را milestone_27 ها & quot؛ برای مشاهده فهرست کامل رفع اشکال
جدید در نسخه 2.0.8 است:
به شکل بهبود یافته برای اجزای سلولی
بهبود قابلیت استفاده چند مانند کپی / چسباندن در منوی popup
نقطه عطف ببینید: & quot؛ را milestone_26 ها & quot؛ برای مشاهده فهرست کامل رفع اشکال
جدید در نسخه 2.0.7 است:
به آیکون نوار ابزار و پانل سمت جدید به آن را آسان تر برای انتخاب انواع فلش و اشکال (با تشکر liubing)
پایگاه های داده مسیر به عنوان منبع داده شامل، به طوری که شما می توانند لینک ها را از یک مسیر را به دیگری اضافه
مبدل BioPAX است بهبود یافته است و تولید اسناد BioPAX معتبر تر است.
نوع اتصال جدید که در آن نقاط فردی را می توان دستکاری (leonth لطف)
تعداد منابع داده شده است به بیش از 180 افزایش یافته است
نقطه عطف ببینید: & quot؛ را milestone_25 ها & quot؛ برای مشاهده فهرست کامل رفع اشکال
جدید در نسخه 2.0.6 است:
به تعداد مجریان در شکل می توان از پیش فرض 12 افزایش یافته است.
افسانه تجسم داده ها هم اکنون می توانید در تصویر مسیر خود را نشان داده است. پیش از این تنها در یک پانل سمت قابل مشاهده بود.
نقطه عطف ببینید: & quot؛ را milestone_24 ها & quot؛ برای مشاهده فهرست کامل رفع اشکال
جدید در نسخه 2.0.4 است:
در بهبود قالب بندی متن از اشکال، برچسب و datanodes
بسیاری از اشکال بیشتری برای datanodes
مختصات ساده پیکسل
رنگ پس زمینه مجموعه ای در datanodes
جدید در نسخه 2.0.3 است:
در اکثر قابل توجه در این نسخه به طرحواره XML جدید برای فرمت مسیر GPML (نسخه 2010a) است. این فرمت مسیر جدید را قادر خواهد ساخت بسیاری از قابلیت های جدید گرافیکی آینده، شما می توانید به جلو به برخی از کسانی که ظاهر می شود در نسخه بعدی نگاه کنید.
دیگر ویژگی های جدید:
مجریان نامرئی واقعا نامرئی، حداقل زمانی که چیزی به آنها متصل (با تشکر از مارگوت)
گزینه خط فرمان -v اضافی (به لطف مارک)
در حال حاضر پایگاه داده انتخاب شده است به درستی در نوار وضعیت نمایش داده دوباره
بسیاری از نقاط فرمت جدید برای پلاگین توسعه دهندگان
نقطه عطف ببینید: & quot؛ را milestone_21 ها & quot؛ برای مشاهده فهرست کامل رفع اشکال
جدید در نسخه 2.0.1 است:
الگوریتم بهبود یافته برای اتصال خودکار که به لنگر اشاره.
طراحی بهبود یافته از انواع فلش است که کوتاه و & quot؛ شکاف ها & quot؛ در پایان.
از آنجا که خدمات freemail THAWTE لغو شده است، ما به روز گواهی امنیتی ما
بیننده تاریخچه مسیر یک اشکال که در آن هر خط اصلاح شده در نظر گرفته شد حال، حتی اگر آن را ندارد. این ثابت شده است.
مورد نیاز:
اوراکل جاوا نسخه استاندارد محیط زمان اجرا
نظر یافت نشد