مراحل یک بسته برای شبیه سازی تصادفی دقیق سیستم واکنش انتشار در هندسه خودسرانه پیچیده 3D است. الگوریتم شبیه سازی اصلی ما اجرای SSA گیلیسپی است، توسعه یافته به مقابله با انتشار مولکول های بیش از عناصر مش چهار ضلعی 3D.در حالی که به طور عمده برای شبیه سازی مدل دقیق از مسیرهای سیگنالینگ عصبی در دندریت ها و اطراف سیناپس...
در خوک خرطوم دراز مالایا یک ابزار پایتون که شامل برنامه به منظور برآورد و رسم ارزشمندی را فیلوژنتیک برای مجموعه داده های بزرگ است.با استناد به خوک خرطوم دراز مالایاهنگام استفاده از خوک خرطوم دراز مالایا، لطفا استناد:- Faircloth قبل از میلاد، چانگ J، آلفارو ME: خوک خرطوم دراز مالایا را قادر می سازد تجزیه و تحلیل توان...
در picme یک بسته که شامل برنامه های پایتون به منظور برآورد و رسم ارزشمندی را فیلوژنتیک برای مجموعه داده های بزرگ است.نصببرای لحظه ای، ساده ترین راه برای نصب این برنامه این است:دستگاه گوارش دستگاه گوارش کلون: //github.com/faircloth-lab/picme.git / راه / به / picmeبرای اجرای آزمون:سی دی / راه / به / picme /آزمون پایتون...
در tigreBrowser یک ژن بیان مرورگر مدل برای نتایج از tigre بسته R است (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html).نصب و راه اندازی:tigreBrowser نیاز به پایتون نسخه> = 2.5. tigreBrowser را می توان با دستور زیر نصب:پایتون setup.py نصببرای کسب اطلاعات بیشتر در مورد نصب ماژول های پایتون (به عنوان...
در checkmyclones نرم افزاری است که ابزار فراهم می کند برای بررسی نتایج توالی سانگر و nbsp است؛ (و یا هر شخصی متن و یا فایل های FASTQ) را در برابر مجموعه ای از توالی مرجع، ارائه شده در هر فرمت منطقی (از جمله مختصات) مورد نیاز: ...
در Syntainia یک برنامه ابتکاری برای تجسم از ژنوم چند است لمس و.. ارائه یک رابط کاربری ساده و شهودی برای مشاهده و دستکاری روابط میان گروه های ژن. با تجسم ژن روشن تر، آن را برای محقق به شناسایی حفاظت synteny در میان ژنوم چند آسان تر است. Syntainia یک برنامه کاربردی دسکتاپ است که به نظر می رسد بزرگ و اجرا می کند هموار...
. CWC شبیه ساز C ++ پیاده سازی CWC، حساب دیفرانسیل و انتگرال برای نمایش و شبیه سازی سیستم های بیولوژیکی و nbsp است؛ پس از نصب موفقیت آمیز (نگاه کنید به نصب) شما قادر خواهید بود برای اجرای شبیه سازی بیش از مدل های CWC، همانطور که در برخی از نمونه های نشان داده شده است (نگاه کنید به نمونه /).(خط فرمان) رابطبه عنوان یک...
در AREM است در MACS بر اساس (تجزیه و تحلیل مبتنی بر مدل برای داده های تراشه SEQ).تعیین توالی بالا در استفاده از همراه به بارش immuno- کروماتین (تراشه SEQ) به طور گسترده ای در توصیف ژنوم الگوهای اتصال عوامل رونویسی، عنوان کوفاکتور، بهبود کروماتین، و سایر پروتئین های DNA اتصال استفاده می شود. یک گام کلیدی در تجزیه و...
در AHREA مجموعه نرم افزار است که باعث پیدا کردن بیان نسبی زبان آموزان آسان است. این است که در پایتون نوشته شده است در مورد نیاز:. ...
در سیستم E-همراه یک مفهوم ساخت سلول های مجازی بر روی کامپیوتر است.سیستم E-همراه-شی گرا مجموعه نرم افزار برای مدل سازی، شبیه سازی و تجزیه و تحلیل سیستم های پیچیده در مقیاس بزرگ مانند سلول های بیولوژیکی، معماری توسط Kouichi تاکاهاشی و نوشته شده توسط یک تیم فوق العاده از توسعه دهندگان است. بخشی از هسته سیستم، E-همراه...
