در MISO (مخلوط ایزوفرم) یک چارچوب احتمالاتی نوشته شده در پایتون که quantitates سطح بیان و nbsp است. ژن معادل متصل از داده های RNA-SEQ، و شناسایی ایزوفرم متفاوت تنظیم و یا اگزون در سراسر نمونه.با مدل سازی فرایند مولد است که توسط آن می خواند از ایزوفرم در RNA-SEQ تولید، مدل MISO استفاده از استنتاج بیزی برای محاسبه...
در کپسید یک پلت فرم جامع منبع باز است که ادغام یک خط لوله محاسباتی با کارایی بالا برای شناسایی توالی پاتوژن و nbsp؛ و خصوصیات در ژنوم انسان و transcriptomes همراه با یک پایگاه داده نتایج مقیاس پذیر و مبتنی بر وب نرم افزار نرم افزار کاربر پسند برای مدیریت، پرس و جو و تجسم نتایج.شروعشما یک پایگاه داده مانگودیبی نیاز،...
در ESMF (زمین سیستم مدل سازی چارچوب) یک برنامه برای ساخت و ساز با کارایی بالا، زیرساخت های نرم افزار انعطاف پذیر برای افزایش سهولت استفاده، قابلیت حمل عملکرد، قابلیت همکاری است، و استفاده مجدد از آب و هوا، پیش بینی آب و هوا عددی، جذب داده، ESMF معماری را تعریف می کند برای آهنگسازی پیچیده، همراه سیستم و مدل سازی و شامل...
در Genepidgin مجموعه ای از ابزار پایتون که در نام محصول ارزیابی و ژن انتساب کمک است را لمس کنید و. سه مولفه اصلی وجود دارد.:genepidgin * * * * * * * * پاک کن& nbsp؛ در استاندارد نام ژن در دستورالعمل نامگذاری UNIPROTgenepidgin * * * * * * * * مقایسه& nbsp؛ از دو یا چند مجموعه از نام ژن مقایسهgenepidgin * * * * * * * *...
در این پروژه STEME زندگی به عنوان یک تقریب به الگوریتم انتظار-Maximisation برای نوع مدل مورد استفاده در یاب موتیف مانند الگوی رفتاری آغاز شده است.STEME برون تقریب EM اجرا می شود منظور از قدر سریع تر از اجرای الگوی رفتاری برای تنظیمات پارامتر معمولی. STEME در حال حاضر به یک یاب موتیف تمام عیار در حق خود توسعه یافته...
پروژه Geant4 ابزار برای شبیه سازی از گذشت ذرات از طریق ماده است.زمینه های کاربرد آن عبارتند از فیزیک انرژی بالا و آزمایش های هسته ای،، شتاب دهنده و فیزیک فضا مطالعات پزشکی چه در این نسخه جدید است. مدل جدید از فعل و انفعالات هسته ای گاما با استفاده از Bertini آبشار اضافه شد.مدل Bertini برای pi-، K-، و Sigma- برای...
سیستم مانند را ساخت اغلب مورد استفاده برای ایجاد گردش کار پیچیده، به عنوان مثال در بیوانفورماتیک و nbsp؛ هدف snakemake برای کاهش پیچیدگی گردش ایجاد شده توسط ارائه یک دامنه به زبان مدرن و تمیز خاص مشخصات (DSL) در سبک پایتون، همراه با یک محیط اعدام سریع و راحت است.نصب- در اوبونتو 12.04، شما می توانید بسته دبیان...
در GPdotNET ابزار هوش مصنوعی برای استفاده از برنامه نویسی ژنتیک و الگوریتم ژنتیک در مدلسازی و بهینه سازی مسائل مختلف مهندسی می باشد. این دات نت (مونو) برنامه نوشته شده در C زبان # برنامه نویسی که می تواند در هر دو ویندوز و سیستم عامل لینوکس اجرا است.GPdotNET در سال 2006 در پروژه کارشناسی ارشد برای مدلسازی و بهینه سازی...
در reciprocal_smallest_distance یک الگوریتم orthology دو به دو که با استفاده از توالی جهانی و حداکثر احتمال فاصله تکاملی بین توالی به دقت تشخیص orthologs بین ژنوم است.نصب از طریق بستهدانلود و untar آخرین نسخه از گیتهاب:سی دی ~-L حلقه...
در NetworkX یک بسته پایتون برای ایجاد، دستکاری، و مطالعه پویایی، ساختار، و توابع شبکه های پیچیده است ویژگی ها:. اجازه می دهد برای 1M + گره، 10M + لبهشامل استاندارد تئوری گراف و توابع فیزیک آماریتبادل آسان از الگوریتم های شبکه بین برنامه های کاربردی، رشته ها، و سیستم عاملشامل بسیاری از نمودار های کلاسیک و شبکه های...
