مشاهده پروتئین پروتئین و لیگاند پروتئین تعاملات به صورت نمودار (شبکه)، که در آن مولکولهای زیستی به عنوان گره نشان و اثر متقابل آنها به عنوان لینک نشان داده، یک روش امیدبخش برای یکپارچه سازی نتایج تجربی از منابع مختلف برای رسیدن به درک سیستماتیک مکانیسم های مولکولی است رانندگی فنوتیپ سلول. ظهور شبکه سیگنالینگ در مقیاس...

در Genes2Networks خط فرمان ابزار نرم افزار است که می تواند مورد استفاده قرار گیرد به جای لیست از ژن های پستانداران در زمینه یک پس زمینه پستانداران signalome و interactome شبکه است. ورودی به برنامه یک لیست از انسان است ENTREZ ژن علامت ژن و شبکه های پس زمینه در فرمت SIG، در حالی که خروجی شامل: همه فعل و انفعالات مشخص...

در حجم نشریات پژوهشی هر روز به پایه انسان دانش در PubMed اضافه طاقت فرسا است. ماندن با پژوهش های اخیر برای موفقیت دانشمندان مهم است. PubMedAlertMe می تواند کمک به کاربران تا به روز با نمایش داده شد در PubMed مورد علاقه خود را نگه دارید. این برنامه قرار است اجرا هم روزانه یا هفتگی. اگر موتور جستجو این برنامه می یابد...

ژنوم mRNA می یک عکس فوری از دولت جهانی از سلول تحت شرایط مختلف فراهم می کند. با این حال، سطوح mRNA را درک مستقیم از مکانیسم نظارتی بالادست ارائه نمی دهد. Expression2Kinases (X2K) یک روش جدید برای شناسایی تنظیم کننده بالادست به احتمال زیاد مسئول تغییرات مشاهده شده در بیان ژن ژنوم است. با یکپارچه سازی تراشه SEQ / تراشه...

GATE

GATE 2014

گیت (تحلیل شبکه از سری زمانی بیان) پلت فرم یکپارچه نرم افزار محاسباتی برای تجزیه و تحلیل و تجسم بالا بعدی زیستی مولکولی سری زمانی است. GATE استفاده از یک الگوریتم خوشه بندی مبتنی بر همبستگی به ترتیب مولکولی سری زمانی در یک آرایه شش ضلعی دو بعدی و به صورت پویا رنگ شش ضلعی فردی با توجه به سطح بیان جزء مولکولی که به آن...