RAPTOR

RAPTOR نرم افزار نوآورانه طراحی شده برای پیش بینی دقیق ساختار پروتئین است. این ترکیب ابزار تجزیه و تحلیل پیشرفته در یک راه حل نرم افزار یکپارچه و سه روش مختلف نخ را فراهم می کند. منحصر به فرد رویکرد بهینه سازی برنامه نویسی صحیح RAPTOR ترین برای پیدا کردن ساختار قالب اهداف با همسانی توالی کم موثر است و قادر به تولید مدل های با کیفیت بالا می باشد. آسان برای استفاده و رابط کاربری آسان و به درک ارزش E ایده آل برای مبتدیان و کارشناسان می باشد. بالاتر از همه، صفحه نمایش بصری از خروجی کاربران را قادر می سازد برای درک نتایج به سادگی در یک نگاه. با توجه به توالی پروتئین هدف، اگر یک پروتئین با تشابه ساختار 3D شناخته شده وجود دارد، می توان آن را با استفاده از ابزار جستجو دنباله مانند PSI-BLAST، همچنین در RAPTOR ارائه در بر داشت. ساختار هدف است و سپس از ساختار شناخته شده ساخته شده است؛ با این حال، زمانی که همسانی توالی قابل توجه نیست، یعنی کمتر از 25 درصد، PSI-BLAST نمی تواند آمد تا با یک ضربه با اعتماد به نفس. بر خلاف PSI-BLAST، که به سادگی انجام می دهد جستجو توالی، نخ پروتئین، برابر به رسمیت شناختن، با استفاده از هر دو همسانی و ساختار اطلاعات. آن را اسکن توالی پروتئین با یک ساختار مجهول با یک پایگاه داده از سازه های شناخته شده است. با استفاده از یک تابع به ثمر رساند و انجام تجزیه و تحلیل سازگاری بین ساختارهای سه بعدی و توالی پروتئین خطی، بهترین قالب ساختاری خواهد شد که از آن برای ساخت ساختار دنباله شناخته شده است. در نتیجه، نخ پروتئین می دهد پیش بینی برتر از مدل سازی همسانی زمانی که همسانی دنباله حاشیه وجود دارد

محدودیت ها:.

به قابلیت محدود