در picme یک بسته که شامل برنامه های پایتون به منظور برآورد و رسم ارزشمندی را فیلوژنتیک برای مجموعه داده های بزرگ است.نصببرای لحظه ای، ساده ترین راه برای نصب این برنامه این است:دستگاه گوارش دستگاه گوارش کلون: //github.com/faircloth-lab/picme.git / راه / به / picmeبرای اجرای آزمون:سی دی / راه / به / picme /آزمون پایتون...
در Pathomx (که قبلا MetaPath) نرم افزار گرافیکی متن باز اجرا در IPython، QT و پایکیوت، طراحی از زمین تا به عنوان یک ابزار تعاملی برای تجسم و تجزیه و تحلیل داده های متابولیک در گنو / لینوکس و دیگر POSIX و nbsp عمل است. عامل سیستم های. در ابتدا مهندسی شده بود برای پردازش متابولومیکی (metabolomics) data.Features در یک...
در Ghemical یک بسته نرم افزار شیمی محاسباتی تحت GNU GPL منتشر شده است. این بدان معنی است که کد منبع کامل بسته در دسترس است، و کاربران رایگان به مطالعه و تغییر بسته بندی می شوند. Ghemical در C ++ نوشته شده است.پروژه Ghemical دارای یک رابط کاربر گرافیکی (که در GNOME بر اساس)، و آن را پشتیبانی از هر دو کوانتومی مکانیک...
در LSim superposes تراکم الکترون ماکرومولکولی و محاسبه نمره شباهت ساختاری. محاسبات آن در مقیاس خطی با اندازه مولکول که در مقایسه با.صف LSim می مفهومی به عناصر ساختاری بیوشیمیایی نامربوط و در نتیجه، بی طرفانه و برای مطالعات شباهت پروتئین تنها ساختار مناسب هستند.نصب و راه اندازی:باز کردن فایل های توزیع:تار -xzvf...
در ProteinShop یک ابزار تعاملی برای دستکاری ساختارهای پروتئینی است. آن را به سرعت ایجاد مجموعه ای از تنظیمات پروتئین با استفاده از دانش بشری و شهود طراحی شده است. این تنظیمات را می توان به بهینه سازی محلی و یا جهانی قرار داشته است. اگر چه ProteinShopمی کند فرآیند بهینه سازی جهانی به خودی خود انجام نشده است، آن را...
در Syntainia یک برنامه ابتکاری برای تجسم از ژنوم چند است لمس و.. ارائه یک رابط کاربری ساده و شهودی برای مشاهده و دستکاری روابط میان گروه های ژن. با تجسم ژن روشن تر، آن را برای محقق به شناسایی حفاظت synteny در میان ژنوم چند آسان تر است. Syntainia یک برنامه کاربردی دسکتاپ است که به نظر می رسد بزرگ و اجرا می کند هموار...
در PEAT مجموعه ای از برنامه های برای گرفتن، پیش بینی و تجزیه و تحلیل ویژگی بیوفیزیکی از پروتئین است.http://enzyme.ucd.ie/PEAT برای اسناد، دستورالعمل ها، تصاویر و غیره مشاهده مورد نیاز:. ...
در edittag مجموعه نرم افزار برای طراحی مجموعه ای از ویرایش برچسب ها دنباله متریک، چک کردن برچسب ها دنباله برای ترکیب به ویرایش متریک، و یکپارچه سازی برچسب ها دنباله به آداپتورهای آنان تعیین توالی پلت فرم خاص و آغازگر PCR است. edittag متفاوت از روش های دیگر:و nbsp؛ * edittag تولید طول دلخواه از تگ های دنباله ویرایش...
در reciprocal_smallest_distance یک الگوریتم orthology دو به دو که با استفاده از توالی جهانی و حداکثر احتمال فاصله تکاملی بین توالی به دقت تشخیص orthologs بین ژنوم است.نصب از طریق بستهدانلود و untar آخرین نسخه از گیتهاب:سی دی ~-L حلقه...
سیستم مانند را ساخت اغلب مورد استفاده برای ایجاد گردش کار پیچیده، به عنوان مثال در بیوانفورماتیک و nbsp؛ هدف snakemake برای کاهش پیچیدگی گردش ایجاد شده توسط ارائه یک دامنه به زبان مدرن و تمیز خاص مشخصات (DSL) در سبک پایتون، همراه با یک محیط اعدام سریع و راحت است.نصب- در اوبونتو 12.04، شما می توانید بسته دبیان...
