در Genepidgin مجموعه ای از ابزار پایتون که در نام محصول ارزیابی و ژن انتساب کمک است را لمس کنید و. سه مولفه اصلی وجود دارد.:genepidgin * * * * * * * * پاک کن& nbsp؛ در استاندارد نام ژن در دستورالعمل نامگذاری UNIPROTgenepidgin * * * * * * * * مقایسه& nbsp؛ از دو یا چند مجموعه از نام ژن مقایسهgenepidgin * * * * * * * *...
مراحل یک بسته برای شبیه سازی تصادفی دقیق سیستم واکنش انتشار در هندسه خودسرانه پیچیده 3D است. الگوریتم شبیه سازی اصلی ما اجرای SSA گیلیسپی است، توسعه یافته به مقابله با انتشار مولکول های بیش از عناصر مش چهار ضلعی 3D.در حالی که به طور عمده برای شبیه سازی مدل دقیق از مسیرهای سیگنالینگ عصبی در دندریت ها و اطراف سیناپس...
. TRMiner ابزار پایتون است که هدف در موزه داران داده های علمی و nbsp است؛ این اجازه می دهد تا به سرعت در حال هرس مجموعه زیادی از نشریات علمی به احکام مربوط به یک هدف استخراج داده شده است.این است که در دو مرحله به دست آورد. اول، متون را به توالی از نشانه برای کلمات مرتبط tranlated. دوم، الگوهای عبارات منظم در توالی...
در سیستم معیار بیوانفورماتیک تلاش برای ساختن یک چارچوب معقول تست، آزمایش و داده ها، به کاربران نهایی قادر و فروشندگان برای بررسی عملکرد سیستم های خود می باشد.چیزی که ما در حال تلاش برای انجام دهید این است برای ایجاد یک چارچوب برای آزمایش، و مجموعه ای از تست های هسته که همه ممکن است دانلود و استفاده به منظور بررسی...
در Staden بسته بندی مجموعه ای کامل توسعه یافته از مونتاژ توالی DNA (Gap4)، ویرایش و ابزار تجزیه و تحلیل (SPIN) برای یونیکس، لینوکس، MacOSX و MS ویندوز است.در جبهه Gap4 چند جزئی پیوستن مرتبط وجود داشته استبهبود در چگونه آن را نمره می پیوندد یافتن پیوندد داخلی وعملکرد دکمه چین در تاریخ ویرایشگر.همچنین در نتیجه به gap4...
در AREM است در MACS بر اساس (تجزیه و تحلیل مبتنی بر مدل برای داده های تراشه SEQ).تعیین توالی بالا در استفاده از همراه به بارش immuno- کروماتین (تراشه SEQ) به طور گسترده ای در توصیف ژنوم الگوهای اتصال عوامل رونویسی، عنوان کوفاکتور، بهبود کروماتین، و سایر پروتئین های DNA اتصال استفاده می شود. یک گام کلیدی در تجزیه و...
در seriesoftubes خط لوله طولانی برای Solexa داده تراشه SEQ است.مستندات بسته بندی در مورد نیاز:...
. MetagenomeDB عمل به عنوان لایه انتزاعی در بالای یک پایگاه داده MongoDB؛ MetagenomeDB یک کتابخانه پایتون طراحی به راحتی ذخیره، بازیابی و حاشیه نویسی توالی metagenomic و nbsp است. آن را فراهم می API برای ایجاد و اصلاح و اتصال دو نوع از اشیاء، یعنی توالی و مجموعه:از & nbsp؛ * * * * توالی (کلاس دنباله) می تواند بار...
مهر ماژول پایتون فراهم می کند که توالی در Hadoop است.مهر و موم از نگاشتکاهش برنامه برای توالی بیولوژیکی است. این در Hadoop (http://hadoop.apache.org) از طریق Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net)، API پایتون نگاشتکاهش و HDFS برای Hadoop اجرا می شود مورد نیاز:. ...
در MISO (مخلوط ایزوفرم) یک چارچوب احتمالاتی نوشته شده در پایتون که quantitates سطح بیان و nbsp است. ژن معادل متصل از داده های RNA-SEQ، و شناسایی ایزوفرم متفاوت تنظیم و یا اگزون در سراسر نمونه.با مدل سازی فرایند مولد است که توسط آن می خواند از ایزوفرم در RNA-SEQ تولید، مدل MISO استفاده از استنتاج بیزی برای محاسبه...
